База KEGG
Общие сведения о метаболическом пути синтеза лизина
В организме лизин определяет не только биологическую ценность белка. Эта аминокислота также
способствует секреции пищеварительных ферментов и транспорту кальция в клетки, улучшает общий азотный баланс в организме.
Как видно на схеме, путь биосинтеза L-лизина может начинаться как с L-аспартата, так и с ацетил-CoА и 2-оксоглутарата. По первому пути промежуточным продуктом
перед самим лизином является мезо-2,6-диаминопимелат. Во втором пути их может быть два - L-Saccharopin и LysW-y-L-lysine.
Этот биохимический путь также пересекается и с другими путями. Например, ацетил-CoA (отмечен зелёным) поставляется из гликолиза. Один из промежуточных продуктов -
L-гомосерин (отмечен синим) - идёт в метаболизм глицина, серина и треонина. Сам L-лизин (серый) может направляться в различные пути - например деградировать или идти на синтез
алкалоидов. Также одно соединение (выделено жёлтым) учавствует в синтезе пептидогликанов.
Метаболический путь биосинтеза лизина в разных доменах жизни
Археи
Выбранный организм: Desulfurococcus amylolyticus
Царство: Crenarchaeota
Отдел: Crenarchaeota
Род: Desulfurococcus
Карта метаболического пути:
Бактерии
Выбранный организм: Escherichia Coli
Отдел: Proteobacteria
Класс: Gammaproteobacteria
Порядок: Enterobacteriales
Семейство: Enterobacteriaceae
Карта метаболического пути:
Эукариоты
Выбранный организм: Saccharomyces cerevisiae
Царство: Fungi
Отдел: Ascomycetes
Класс: Saccharomycetes
Карта метаболического пути:
Как видно из карт, у архей из пути присутствует всего 3 фермента, и ни один вариант синтеза полностьб не завершён, поэтому очень маловероятно, что археи могут использовать этот путь.
У бактерий присутствует 12 ферментов, у эукариот (дрожжа) - 14. Они оба могут синтезировать лизин, но разными путями.
Реакция окисления мезо-2,6-диаминопимелата в базе данных KEGG
Ссылка на страницу в KEGG
Идентификатор: R02755
Данная реакция выделена фиолетовым цветом на схеме пути метаболизма лизина
Схема реакции:
© Иззи Антон,2019