Геномные браузеры

Задание 1. UCSC

С помощьюгеномного браузера UCSC был произведён поиск фосфофруктокиназы человека. Информация о гене:

Полное имя гена - Human muscle phosphofructokinase, короткое - PFKM. Закодирован на прямой цепи. Находится в 12-й хромосоме. Плечо и полоса - chr12:q13.11. Координаты гена в хромосоме - 48,120,104-48,146,865. В гене закодировано 11 альтернативных продуктов. 1-й продукт - 23 экзона, 40,941 остаток. 2-й продукт - 23 экзона, 40,291 остаток. 3-й продукт - 21 экзон, 40,007 остатков.

Задание 2. Ensembl

В данном случае было произведено выравнивание выбранного гена человека с геном шимпанзе и определно число различий и полиморфизмов.

Выравнивание:

выравнивание

Всего было обнаружено 11881 полиморфизм. Раличий окаалось примерно 322.

© Иззи Антон,2018