Частоты встречаемости аминокислотных остатков в протеомах бактерий E.coli и Methylomicrobium alcaliphilum

Некоторая информация о протеомах:

E.coli(strain K12)

Protein ID: UP000000625

Proteins amount: 4313

Aminoacids amount: 1351622

Methylomicrobium alcaliphilum (strain DSM 19304 / NCIMB 14124 / VKM B-2133 / 20Z)

Protein ID: UP000008315

Proteins amount: 4041

Aminoacids amount: 1287047

Процентное содержание аминокислот в протеомах и их сравнение у двух видов бактерий

Амонокислоты

Methylomicrobium alcaliphilum (strain DSM 19304 / NCIMB 14124 / VKM B-2133 / 20Z)

E.coli(strain K12)

Разница в процентах (M.alcalifillum - E.coli)

Всего

100%

100%

0%

L

10,76720586

10,67576586

0,091440002

A

8,833554641

9,51153503

-0,677980389

G

6,885063249

7,370477841

-0,485414591

I

6,64319174

6,009816354

0,633375386

E

6,463633418

5,765961193

0,697672225

V

6,444597594

7,073057408

-0,628459814

S

6,049973311

5,796665044

0,253308267

D

5,753169853

5,149146729

0,604023124

R

5,610051537

5,518628729

0,091422808

T

5,058245736

5,394037682

-0,335791946

K

5,035946628

4,405743618

0,630203011

P

4,306214148

4,428309098

-0,122094951

Q

4,244988722

4,443402075

-0,198413353

F

4,142739154

3,892656379

0,250082775

N

3,88750372

3,936899518

-0,049395798

Y

2,915822033

2,844656272

0,071165761

M

2,398746899

2,822534703

-0,423787804

H

2,288028332

2,267719821

0,02030851

W

1,25877299

1,531863198

-0,273090209

C

1,012550435

1,160901495

-0,148351059

U

0

0,000221956

-0,000221956

Комментарии к таблице

По результатам подсчётов у бактерии Methylomicrobium alcaliphilum самыми распространёнными кислотными остатками являются Лейцин ,Аланин и Глицин, также как и у E.coli. Самыми редкими аминокислотными остатками у Methylomicrobium alcaliphilum оказались Цистеин ,Триптофан и Гистидин, как и у E.coli. На удивление разности в процентном содержании аминокислот у двух бактерий оказались довольно низкие, тоесть не набралось и одного процента. Всё же наибольшая разность в пользу E.coli по Аланину (-0,677980389%), в пользу Methylomicrobium alcaliphilum - по Глутаминовой кислоте (0,697672225%).

Файл с таблицой:

Excel

© Иззи Антон,2018