Практикум 1

Задание 1

Отобранные бактерии

Название	Мнемоника
Acidothermus cellulolyticus	ACIC1
Corynebacterium diphtheriae	CORDI
Corynebacterium efficiens	COREF
Mycobacterium leprae	MYCLE
Mycolicibacterium vanbaalenii	MYCVP
Rhodococcus jostii	RHOJR
Rubrobacter xylanophilus	RUBXD
Thermobifida fusca	THEFY

Скобочная формула дерева

(((THEFY, ACIC1), (((MYCVP, MYCLE), RHOJR), (COREF, CORDI))), RUBXD);

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит 5 нетривиальных ветвей:

1. {THEFY, ACIC1} против {MYCVP, MYCLE, RHOJR, COREF, CORDI, RUBXD}
2. {MYCVP, MYCLE} против {THEFY, ACIC1, RHOJR, COREF, CORDI, RUBXD}
3. {MYCVP, MYCLE, RHOJR} против {THEFY, ACIC1, COREF, CORDI, RUBXD}
4. {COREF, CORDI} против {THEFY, ACIC1, MYCVP, MYCLE, RHOJR, RUBXD}
5. {MYCVP, MYCLE, RHOJR, COREF, CORDI} против {THEFY, ACIC1, RUBXD}

Практикум 2

Задание 1

Классификация

Все выбранные бактерии принадлежат к отделу Actinomycetota (cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group).

Мнемоника	Класс	Порядок	Семейство	Род
ACIC1	Actinomycetes	Acidothermales	Acidothermaceae	Acidothermus
CORDI	Actinomycetes	Mycobacteriales	Corynebacteriaceae	Corynebacterium
COREF	Actinomycetes	Mycobacteriales	Corynebacteriaceae	Corynebacterium
MYCLE	Actinomycetes	Mycobacteriales	Mycobacteriaceae	Mycobacterium
MYCVP	Actinomycetes	Mycobacteriales	Mycobacteriaceae	Mycolicibacterium
RHOJR	Actinomycetes	Mycobacteriales	Nocardiaceae	Rhodococcus
RUBXD	Rubrobacteria	Rubrobacterales	Rubrobacteraceae	Rubrobacter
THEFY	Actinomycetes	Streptosporangiales	Nocardiopsaceae	Thermobifida

Нетривиальные ветви, выделяющие таксоны

• {MYCVP, MYCLE} против {THEFY, ACIC1, RHOJR, COREF, CORDI, RUBXD} -
  cемейство Mycobacteriaceae.
• {COREF, CORDI} против {THEFY, ACIC1, MYCVP, MYCLE, RHOJR, RUBXD} -
  семейство Corynebacteriaceae, род Corynebacterium.
• {MYCVP, MYCLE, RHOJR, COREF, CORDI} против {THEFY, ACIC1, RUBXD} -
  порядок Mycobacteriales.