Deformed wing virus(DWV) — РНК-вирус, один из 20 известных вирусов, вызывающих болезни у медоносных пчел, Apis mellifera. Вирус впервые был выделен из больных пчел в начале 80-х годов XX века в Японии, на данный момент распространен повсеместно. Основным переносчиком DWV между пчелами является паразитический клещ Varroa. Название вируса дано по наиболее явному повреждению, которое он вызывает в развивающейся куколке — сморщиванию и деформации крыльев, хотя есть и другие симптомы.
Вирион имеет форму икосаэдра размером около 30 нм, он состоит из генома(одной линейной молекулы РНК положительной полярности) и трех основных структурных белков.
Геном вируса может быть обнаружен с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскриптазой в голове, груди, брюшке и крыльях зараженных пчел (во всех частях тела, кроме ног).
Существует предположение, что DWV вызывает деформации крыльев и брюшка, часто наблюдаемые в колониях, пораженных клещами Varroa. Зараженные пчелы обычно имеют поврежденные придатки, укороченные, нефункциональные крылья, укороченное, закругленное брюшко, нехарактерно окрашенные и парализованные конечности. Пчелы, имеющие данные симптомы, имеют меньшую продолжительность жизни (обычно меньше 48 часов) и обычно изгоняются из улья.
В отсутствие клещей заражение вирусом часто протекает в бессимптомной форме; вирус передается между взрослыми (рабочими) пчелами вместе с маточным молочком и от матки или трутня к потомству.
Тяжелые симтомы при заражении DVW проявляются, когда улей также заражен клещом Varroa destructor. Он является переносчиком вируса, возможно, в организме клеща происходит также увеличение количества частиц вируса. Кроме того, сочетание зараждения вирусом и клещом приводит к резкому снижению иммунитета и увеличивает уязвимость для оппортунистических инфекций. Это, как предполагается, является распространенной причиной синдрома разрушения пчелиной семьи [1].
В таблице 1 приведены некоторые важные показатели, характеризующие геном Deformed wing virus:
Латинское название вируса | Deformed wing virus |
Русское название вируса | Вирус деформации крыла |
Количество фрагментов в полном геноме | 1 |
Общая длина генома, п.н. | 10140 [1] |
Количество кодируемых в геноме белков | 1 (полипротеин) [2] |
Далее представлена аминокислотная последовательность белка вируса в FASTA-формате [3]:
>gi|31540604|gb|AAP49283.1| polyprotein [Deformed wing virus] MAFSCGTLSYSAVAQAPSVAYAPRTWEVDEARRRRVIKRLALEQERIRNVLDVGVYDQAT WEQEDARDNEFLTEQLNNLYTIYSIAERCTRRPIKEYSPISVSNRFAPLESLKVEVGQEA GECIFKKPKYTRVCKKVKRVATRFVREKVVRPMCSRSPMLLFKLKKIIYDLHLYRLRKQI RMLRRQKQRDYELECVTNLLQLSNPVQAKPEMDNPNPGPDGEGEVELEKDSNVVLTTQRD PSTSIPAPVSVKWSRWTSNDVVDDYATITSRWYQIAEFVWSKDDPFDKELARLILPRALL SSIEANSDAICDVPNTIPFKVHAYWRGDMEVRVQINSNKFQVGQLQATWYYSDHEDLNIS SKRSVYGFSQMDHALISASASNEAKLVIPFKHVYPFLPTRIVPDWTTGILDMGALNIRVI APLRMSATGPTTCNVVVFIKLNNSEFTGTSSGKFYASQIRAKPEMDRILNLAEGLLNNTI GGNNMDNPSYQQSPRHFVPTGMHSLALGTNLVEPLHALRLDAAGTTQHPVGCAPDEDMTV SSIASRYGLIRRVQWKKDHAKGSLLLQLDADPFVEQRIEGTNPISLYWFAPVGVVSSMFM QWRGSLEYRFDIIASQFHTGRLIVGYVPGLTASLQLQMDYMKLKSSSYVVFDLQESNSFT FEVPYVSYRPWWVRKYGGNYLPSSTDAPSTLFMYVQVPLIPMEAVSDTIDINVYVRGGSS FEVCVPVQPSLGLNWNTDFILRNDEEYRAKTGYAPYYAGVWHSFNNSNSLVFRWGSASDQ IAQWPTISVPRGELAFLRIKDGKQAAVGTQPWRTMVVWPSGHGYNIGIPTYNAERARQLA QHLYGGGSLTDEKAKQLFVPANQQGPGKVSNGNPVWEVMRAPLATQRAHIQDFEFIEAIP EGEESRNTTVLDTTTTLQSSGFGRAFFGEAFNDLKTLMRRYQLYGQLLLSVTTDKDIDHC MFTFPCLPQGLALDIGSAGSPHEIFNRCRDGIIPLIASGYRFYRGDLRYKIVFPSNVNSN IWVQHRPDRRLEGWSAAKIVNCDAVSTGQGVYNHGYASHIQITRVNNVIELEVPFYNATC YNYLQAFNASSAASSYAVSLGEISVGFQATSDDIASIVNKPVTIYYSIGDGMQFSQWVGY QPMMILDQLPAPVVRAVPEGPIAKIKNFFHQTADEVREAQAAKMREDMGMVVQDVIGELS QAIPDLQQPEVQANVFSLVSQLVHAIIGTSLKTVAWAIVSIFVTLGLIGREMMHSVITVV KRLLEKYHLATQPQESASSSTVISAVPEAPNAEAEEASAWVSIIYNGVCNMLNVAAQKPK QFKDWVKLATVDFSNNCRGSNQVFVFFKNTFEVLKKMWGYVFCQSNPAARLLKAVNDEPE ILKAWVKECLYLDDPKFRMRRAHDQEYIERVFAAHSYGQILLHDLTAEMNQSRNLSVFTR VYDQISKLKTDLMEMGSNPYIRRECFTICMCGASGIGKSYLTDSLCSELLRASRTPVTTG IKCVVNPLSDYWDQCDFQPVLCVDDMWSVETSTTLDKQLNMLFQVHSPIVLSPPKADLEG KKMRYNPEIFIYNTNKPFPRFDRIAMEAIYRRRNVLIECKASEEKKRGCKHCENDIPIAE CSPKMLKDFHHIKFRYAHDVCNSETTWSEWMTYNEFLEWITPVYMANRRKANESFKMRVD EMQMLRMDEPLEGDNILNKYVEVNQRLVEEMKAFKERTLWSDLHRLGAEISASVKKALPT ISITEKLPHWTVQCGIAKPEMDHAYEVMSSYAAGMNAEIEAHEQVRRSSVECQYAEPQAP RNPDDEGPTIDEELMGDTEFTSQALERLVDEGYITGKQKKYIATWCSKRREHTADFDLVW TDNLRVLSAYVHERSSSTRLSTDDVKLYKTISMLHQKYDTTECAKCQHWYAPLTDIYVDD KKLFWCQKEKKTLIDVRKLSKEDVTVQSKLINLSVPCGDVCMLHSKYFNYLFHKAWLFEN PTWRLIYNGTKKGMPEYFMNCVDEISLDSKFGKVKVWLQAIIDKYLTRPVKMIRDFLFKW WPQVAYVLSLLGIIGITAYEMRNPKPTSEELADHYVNRHCSSDFWSPGLASPQGLKYSEA VTVKAPRIHRLPVTTKPQGSTQQVDAAVNKILQNMVYIGVVFPKVPGSKWRDINFRCLML HNRQCLMLRHYIESTAAFPEGTKYYFKYIHNQETRMSGDISGIEIDLLNLPRLYYGGLAG EESFDSNIVLVTMPNRIPECKSIIKFIASHNEHIRAQNDGVLVTGDHTQLLAFENNNKTP ISINADGLYEVILQGVYTYPYHGDGVCGSILLSRNLQRPIIGIHVAGTEGLHGFGVAEPL VHEMFTGKAIESEREPYDRVYELPLRELDESDIGLDTDLYPIGRVDAKLAHAQSPSTGIK KTLIHGTFDVRTEPNPMSSRDPRIAPHDPLKLGCEKHGMPCSPFNRKHLELATNHLKEKL VSVVKPINGCKIRSLQDAVCGVPGLDGFDSISWNTSAGFPLSSLKPPGTSGKRWLFDIEL QDSGCYLLRGMRPELEIQLSTTQLMRKKGIKPHTIFTDCLKDTCLPVEKCRIPGKTRIFS ISPVQFTIPFRQYYLDFMASYRAARLNAEHGIGIDVNSLEWTNLATRLSKYGTHIVTGDY KNFGPGLDSDVAASAFEIIIDWVLHYTEEDNKDEMKRVMWTMAQEILAPSHLYRDLVYRV PCGIPSGSPITDILNTISNCLLIRLAWLGITDLPLSEFSQNVVLVCYGDDLIMNVSDNMI DKFNAVTIGKFFSQYKMEFTDQDKSGNTVKWRTLQTATFLKHGFLKHPTRPVFLANLDKV SVEGTTNWTHARGLGRRTATIENAKQALELAFGWGPEYFNYVRNTIKMAFDKLGIYEDLI TWEEMDVRCYASA