(длина отрезка равна 0.5 мкм)
Desulfovibrio vulgaris — сульфатредуцирующая бактерия (энергетический обмен основан на восстановлении сульфатов до сульфидов). Встречается в различных водных и почвенных местообитаниях, богатых сульфатами. Вместе с другими сульфатредуцирующими бактериями играет важную роль в круговоротах серы и углерода в природе. Desulfovibrio vulgaris связывает токсичные ионы, в частности, уран(VI), хром(VI), железо(III): предполагается, что это свойство можно использовать для очистки окружающей среды от промышленных загрязнений. Данная бактерия наносит вред нефтедобывающей промышленности, участвуя в биологической коррозии [1].
Результаты секвенирования генома данной бактерии (рассматривался другой штамм — Hildenborough) были опубликованы в журнале Nature Biotechnology 11 апреля 2004 года [1], геном штамма 'Miyazaki F' (предполагается, что между штаммами имеются отличия в энергетическом обмене [2]) секвенирован 11 декабря 2013 года. Согласно результатам секвенирования, длина генома Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F' составляет 4040304 пар нуклеотидов [3].
Далее представлена гистограмма, отражающая распределение белков бактерии по длине:
Histogram of protein lengths in Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F' chromosome Range Count 1..100 229 101..200 667 201..300 729 301..400 562 401..500 383 501..600 238 601..700 137 701..800 73 801..900 61 901..1000 35 >1000 66 Total 3180
Можно заметить, что наиболее часто встречаются белки с длиной из диапазона 201..300 (аминокислотных остатков) и соседних с ним (101..200 и 301..400).