Учебный сайт Сергея Маргасюка

Краткое описание белка YP_002434696.1 бактерии Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F.'

Белок YP_002434696.1 — малая субъединица HydA гидрогеназы (NiFe) (фермента, ускоряющего циклическое окисление-восстановление водорода в ходе энергетического обмена). В таблице 1 содержится описание этого белка:

Таблица 1: Описание белка малой субъединицы (HydA) гидрогеназы (NiFe) из генома бактерии Desulfovibris vulgaris str. 'Miyazaki F'
Идентификатор белка YP_002434696.1
Идентификатор GI 218885375
Идентификатор генома NC_001769
Координаты гена в геноме 309580..310533
Длина гена (в парах нуклеотидов) 954
Цепь (прямая или обратная) Обратная
Длина белка (в аминокислотных остатках) 317

Далее представлена аминокислотная последовательность белка в FASTA-формате: 

>YP_002434696.1 hydrogenase (NiFe) small subunit HydA
MKISIGLGKEGVEERLAERGVSRRDFLKFCTAIAVTMGMGPAFAPEVARALMGPRRPSVV
YLHNAECTGCSESVLRAFEPYIDTLILDTLSLDYHETIMAAAGDAAEAALEQAVNSPHGF
IAVVEGGIPTAANGIYGKVANHTMLDICSRILPKAQAVIAYGTCATFGGVQAAKPNPTGA
KGVNDALKHLGVKAINIAGCPPNPYNLVGTIVYYLKNKAAPELDSLNRPTMFFGQTVHEQ
CPRLPHFDAGEFAPSFESEEARKGWCLYELGCKGPVTMNNCPKIKFNQTNWPVDAGHPCI
GCSEPDFWDAMTPFYQN

Далее представлена диаграмма 1, отражающая геномное окружение данного белка [1]:

Диаграмма 1: геномное окружение малой субъединицы (HydA) гидрогеназы (NiFe) из генома бактерии Desulfovibris vulgaris str. 'Miyazaki F'
(промежуток 308149..311964)

Ссылки:

© Сергей Маргасюк, 2015