Учебный сайт Сергея Маргасюка

Частоты встречаемости остатков в протеомах Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F.' и Escherichia coli str. K12

Далее представлена таблица, содержащая информацию о частоте встречаемости различных аминокислот в протеомах Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F.' и Escherichia coli str. K12:

Таблица 1: встречаемость аминокислотных остатков в геномах Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F.' и Escherichia coli str. K12

Частота встречаемости в геноме Escherichia coli str. K12, % Частота встречаемости в геноме Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F.', % Разность частот, %
A 9.52 12.56 3.05
L 10.67 10.53 -0.15
G 7.37 8.95 1.58
V 7.07 7.73 0.66
R 5.51 7.54 2.02
D 5.15 5.76 0.61
P 4.43 5.76 1.34
E 5.76 5.66 -0.11
T 5.40 5.25 -0.15
S 5.80 4.89 -0.91
I 6.01 4.02 -1.99
F 3.89 3.37 -0.52
Q 4.44 3.01 -1.43
K 4.41 2.94 -1.46
M 2.82 2.69 -0.13
N 3.95 2.40 -1.55
H 2.27 2.30 0.03
Y 2.85 2.17 -0.68
C 1.16 1.30 0.15
W 1.53 1.18 -0.35
U 0.00 0.00 0.00

Опишем некоторые свойства полученных данных. Порядок следования аминокислот при сортировке по убыванию встречаемости в этих протеомах различен. Несмотря на это, в обоих протеомах три самых частых остатка — A, L, G; три самых редких — U, W, C. Самая большая разность по числу вхождений получена для остатка изолейцина: в геноме Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F.' он встречается на 36929 раз меньше.


© Сергей Маргасюк, 2015