Учебный сайт Сергея Маргасюка

Изображение филогенетического дерева

При выполнении данного правктикума было изображено филогенетическое дерево для выбранных организмов. Далее вместо названий выбранных организмов использованы краткие мнемонические обозначения; в таблице 1 представлен список видов с обозначениями.

Таблица 1: выбранные организмы
ОрганизмМнемоника
Bacillus anthracisBACAN
Clostridium botulinumCLOBA
Enterococcus faecalisENTFA
Geobacillus kaustophilusGEOKA
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricusLACDA
Listeria monocytogenes serovar 1/2aLISMO
Staphylococcus epidermidisSTAES

Скобочная форма дерева:
(((((BACAN,GEOKA),LISMO),STAES),(ENTFA, LACDA)),CLOBA);

Рисунок 1: филогенетическое дерево
Ветви дерева:
  1. {BACAN, GEOKA} против {LISMO, STAES, LACDA, CLOBA, ENTFA}
  2. {BACAN, GEOKA, LISMO} против {STAES, LACDA, CLOBA, ENTFA}
  3. {BACAN, GEOKA, LISMO, STAES} против {LACDA, ENTFA, CLOBA}
  4. {ENTFA, LACDA} против {BACAN, GEOKA, LISMO, CLOBA, STAES}
Таблица 2: таксономия выбранных организмов (ниже отдела Firmicutes)
МнемоникаТаксономия
BACANBacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus
CLOBAClostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium
ENTFABacilli; Lactobacillales; Enterococcaceae; Enterococcus
GEOKABacilli; Bacillales; Bacillaceae; Geobacillus; Geobacillus
LACDABacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus
LISMOBacilli; Bacillales; Listeriaceae; Listeria
STAESBacilli; Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus

Из описанных нетривиальных ветвей выделяют таксоны первая (Bacillaceae), третья (Bacillales) и четвертая (Lactobacillales).

© Сергей Маргасюк, 2015-2016