Из структуры белка для исследования была выбрана альфа-спираль (остатки 19-36).
На рисунке элемент изображен в ленточном виде, остальная часть белка - в остовном:
Водородные связи между остовными атомами выбранной альфа-спирали:
 |
На изображении фрагмента спирали подписаны номера остатков, включающие атомы, которые могут участвовать в таких водородных связях. Такими атомами считаются остовные атомы азота и кислорода, удаленные друг от друга не более чем на 3.7 ангстрем (длина водородной связи). Т. к. в водородных связях участвуют аминокислоты на разных витках спирали, а один виток альфа-спирали содержит 3,6 аминокислоты, то связи образуются через 4 аминокислоты, что подтверждается рисунком (на рисунке показаны водородные связи, образующиеся между остатками с номерами: 22 - 26, 23 - 27, 24 - 28; то есть в общем виде n - n+4). |