Консервативные аминокислотные остатки в выборке 10 потенциальных ортологов CYOB_ECOLI

Матрица попарного сходства последовательностей выборки ортологов

Получены 10 последовательностей ортологов белка CYOB_ECOLI (использован поиск по nr в blastp, так как в SWISS-Prot нашлось мало ортологов). Множественное выравнивание полученных последовательностей выполнено с помощью программы emma. С помощью Genedoc составлена матрица попарного совпадения последовательностей (измерено в процентах как отношение числа совпавших пар аминокислот к общему числу пар аминокислот).

NP_636534.1 AAM36130.1 AAP22949.1 NP_883388.1 NP_887830.1 NP_881514.1 NP_800138.1 NP_660787.1 NP_240282.1 NP_878541.1 NP_636534.1 100% AAM36130.1 95% 100% AAP22949.1 72% 73% 100% NP_883388.1 71% 71% 70% 100% NP_887830.1 71% 71% 69% 99% 100% NP_881514.1 71% 71% 69% 99% 99% 100% NP_800138.1 64% 63% 63% 63% 63% 63% 100% NP_660787.1 62% 63% 64% 64% 64% 64% 62% 100% NP_240282.1 62% 62% 63% 63% 63% 63% 63% 83% 100% NP_878541.1 62% 61% 61% 62% 62% 62% 63% 67% 65% 100%

Множественное выравнивание последовательностей выборки ортологов

* 2 0 * 4 0 * 6 0 * 8 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : - M L G K L T I E A V P Y H E P I I M I A L G G A G L L G L L I A G A I T K Y K L W G Y L W N E W F T S V D H K R I G V M Y I I V A L I M L L R G F A D A A M M R : 8 0

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : - M L G K L T I E A V P Y H E P I I M V A L G G A G L L G L L I A G A I T K Y K L W G Y L W K E W F T S V D H K R I G V M Y I I V A L V M L L R G F A D A A M M R : 8 0

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : - M L G K L S L E S I P - H D P I V L T T L V G A V L G G L G V M A L I T K F K L W G Y L W K E W F T S V D H K K I G V M Y L I V A F V M L L R G F S D A I M M R : 7 9

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : M M F G K L S L E A I P F H D P I I M G T M V V V I L G G A T L L G A V T Y F G K W K Y L W T E W F T S V D H K K I G I M Y I I V A L V M L L R G F A D A I M M R : 8 1

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : M M F G K L S L E A I P F H D P I I M G T M V V V I L G G A T L L G A V T Y F G K W K Y L W T E W F T S V D H K K I G I M Y I I V A L V M L L R G F A D A I M M R : 8 1

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : - M F G K L S L E A I P F H D P I I M G T M V V V I L G S A T L L G A V T Y F G K W K Y L W T E W F T S V D H K K I G I M Y I I V A L V M L L R G F A D A I M M R : 8 0

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : - M F G R L T L D S I P Y H E P I I I I T L A I V A L V G L A V V V A V T K A G K W Q Y L W N E W F T S V D H K K L G F M Y I A V A M L M L V R G F A D A V M M R : 8 0

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : - M F G K L T L K A I P V D E P I I M V T Y I S I I L I A L F I S F S I T Y F K K W K Y L W Y E W F T T V D H K K I S I M Y G I L A F I M L F R G F V D A I L M R : 8 0

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : - M F G K L T F D A I P Y H E P I I M I T Y I A I I L I A L C I A S T I T Y Y K K W K Y L W Y E W F T T V D H K K I S I M Y G I L A F V M L F R G F V D A I L M R : 8 0

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : - M F G K L T V H S I P Y E D P I I M S T I V M I F I A G V I M T G M I T Y Y N Q W K Y L W C E W L T S V D H K K I G I M Y I I I S C I M F L R G F T D A I M M R : 8 0

M G 4 L 3 6 P h P I 6 6 t 6 6 6 T W Y L W E W f T 3 V D H K 4 6 g M Y i 6 a 6 M l R G F D A 6 M R

* 1 0 0 * 1 2 0 * 1 4 0 * 1 6 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : T Q Q A L A G N G G E G V L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F M A M P F M T G L L N L I V P L Q I G A R D V A F P F L N S L S F W L F V A G A A L I N I S L G : 1 6 1

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : T Q Q A L A G G G G E G V L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F M A M P F M T G L L N L I V P L Q I G A R D V A F P F L N S L S F W L F V A G A A L I N I S L G : 1 6 1

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : T Q Q A L A V G G S E G Y L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F V A M P L I T G L M N L A V P L Q I G A R D V A F P F V N S L S F W L F V S G A V L I M L S L W : 1 6 0

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : T Q Q A V A S A D S A G F L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F M A M P F I T G L M N I V V P L Q I G A R D V A Y P F L N S L S F W L F M V G V V L L M L S L F : 1 6 2

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : T Q Q A V A S A D S A G F L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F M A M P F I T G L M N I V V P L Q I G A R D V A Y P F L N S L S F W L F M V G V V L L M L S L F : 1 6 2

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : T Q Q A V A S A D S A G F L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F M A M P F I T G L M N I V V P L Q I G A R D V A Y P F L N S L S F W L F M V G V V L L M L S L F : 1 6 1

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : S Q Q L L S S A G E A G Y L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F V A M P L V I G L M N I I V P L Q I G A R D V A F P Y L N N L S F W L F V V G V I L T N M S L G : 1 6 1

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : T Q Q V I A S S G N T G F L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F V A M P L V I G L M N L V V P L Q I G A R D V A F P F L N N L S F W L N V S G A I L L T L S L G : 1 6 1

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : T Q Q V V A S A G F K G F L P P H H Y D Q I F T A H G V I M I F F V A M P L V I G L M N L V I P L Q I G A R D V A F P F L N N L S F W L N V S S A V L L T L S L G : 1 6 1

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : T Q Q T L S S I G S S E F L S P H H Y D Q V V T A H G V I M I I F M A T P F V I G L M N L I V P L Q I G A R D V A F P F L N S L S F W L F M V G V I L I N L S L G : 1 6 1

3 Q Q 6 a g L p P H H Y D Q 6 f T A H G V I M I f F 6 A m P 6 G L 6 N 6 6 P L Q I G A R D V A 5 P 5 6 N L S F W L f 6 g L 6 S L

* 1 8 0 * 2 0 0 * 2 2 0 * 2 4 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : V G E F A Q T G W L A Y P P L S G L E Y S P G V G V D Y Y I W A L Q V S G L G T L L T G V N F F V T I M R M R A P G M T L M R M P I F T W T A L I T N I L I I A A : 2 4 2

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : V G E F A Q T G W L A Y P P L S G L E Y S P G V G V D Y Y I W A L Q V S G L G T L L T G I N F F V T I M R M R A P G M T L M R M P I F T W T A L I T N I L I I A A : 2 4 2

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : I G E F A A T G W L A F P P L S G I E Y S P S V G M D Y Y I W G L Q V A G L G T T L S G I N F F I T I L K M R T P S M K L M Q M P V F T W T A L V T N V L I V A A : 2 4 1

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : V G E F A A T G W L A Y P P L S G L D Y S P G V G V D Y Y L W A L Q L S G L G T T L S G I N F I V T I M K M R A P G M A L M K M P V F T W T A L V T N I L I V A A : 2 4 3

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : V G E F A A T G W L A Y P P L S G L D Y S P G V G V D Y Y L W A L Q L S G L G T T L S G I N F I V T I M K M R A P G M A L M K M P V F T W T A L V T N I L I V A A : 2 4 3

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : V G E F A A T G W L A Y P P L S G L D Y S P G V G V D Y Y L W A L Q L S G L G T T L S G I N F I V T I M K M R A P G M A L M K M P V F T W T A L V T N I L I V A A : 2 4 2

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : L G E F G R T G W L A Y P P L S G I E A S P G V G V D Y W I W A L Q I S G V G T T L T G V N F F A T I L R M R T P S M P M M K M P V F T W A S L C A N I L I I I S : 2 4 2

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : I G E F A Q T G W L A Y P P L S E V K Y S P G V G V D Y W I W S L Q I S G V G T T L T G I N F L I T I L K M R A P G M C F F K M P V F T W A A L C T N I L I V I S : 2 4 2

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : I G E F A Q T G W L A Y P P L S G I K Y S S G V G V D Y W I W S L Q I S G V G T T L T G I N F L V T I L K M R A P G M S F F K M P V F T W T S L C T N I L I V I S : 2 4 2

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : I G E F A Q T G W A A Y P P L S S K I Y S P D V G V D Y W I W S I Q I S G I G T T L T G I N F F T T I L Y M R A P G M L M M K M P V F T W T A L C T N A L I I I A : 2 4 2

6 G E F a T G W l A 5 P P L S g y S p g V G 6 D Y 5 6 W 6 Q 6 s G 6 G T t L 3 G 6 N F T I 6 M R a P g M m M P 6 F T W t a L t N L I 6

* 2 6 0 * 2 8 0 * 3 0 0 * 3 2 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : F P I L T V A L A L L G A D R Y L G T H F F T N D G G G N A M M Y V N L I W I W G H P E V Y I L I L P A F G I F S E L I A T Y S R K R L F G Y T S M V Y A T A C I : 3 2 3

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : F P I L T V A L A L L G A D R Y L G T H F F T N D G G G N A M M Y V N L I W I W G H P E V Y I L I L P A F G I F S E L I A T Y S R K R L F G Y T S M V Y A T S C I : 3 2 3

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : F P V L T I T L V L L T L D R Y L G T H F F T N D G G G N A M L Y I N L I W I W G H P E V Y I L V L P A F G V F S E V I A T F S R K A L F G Y K G M V Y A T A C I : 3 2 2

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : F P V L A A T L A L L T L D R Y L D M H F F T N D L G G N V M M Y V N L I W I W G H P E V Y I L V L P C F G V F S E I V A T Y S K K T L F G Y K S M V Y A T A S I : 3 2 4

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : F P V L A A T L A L L T L D R Y L D M H F F T N D L G G N V M M Y V N L I W I W G H P E V Y I L V L P C F G V F S E I V A T Y S K K T L F G Y K S M V Y A T A S I : 3 2 4

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : F P V L A A T L A L L T L D R Y L D M H F F T N D L G G N V M M Y V N L I W I W G H P E V Y I L V L P C F G V F S E I V A T Y S K K T L F G Y K S M V Y A T A S I : 3 2 3

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : F P I L T V T I A L L T L D R Y L G M H F F T N D L G G N V M M Y V N L I W A W G H P E V Y I L V L P I F G V F S E V T A T F S R K K L F G Y T S L V W A T I V I : 3 2 3

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : F P V L T T T L L L L T L D R C F D F H F F T N N F G G N P M M Y V N L I W I W G H P E V Y I L V L P V F G V F S E V V A T F S K K R L F G Y V S L V W A T L A I : 3 2 3

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : F P V L T V T L V L L T L D R Y F N F H F F T N D L G G N A M M Y V N L I W I W G H P E V Y I L V L P V F G V F S E V V A T F S K K R L F G Y V S L V W A T L S I : 3 2 3

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : F P I L T V T I A L L T F D R Y L D T H F F T N D L G G N M M M Y I N L F W A W G H P E V Y I L V L P A F G I F S E V V S T F S Q K Q I F G Y T A L V W A T I A I : 3 2 3

F P 6 L t 6 L L t D R y l H F F T N 1 G G N M 6 Y 6 N L i W i W G H P E V Y I L 6 L P F G 6 F S E 6 a T 5 S K 6 F G Y s 6 V 5 A T I

* 3 4 0 * 3 6 0 * 3 8 0 * 4 0 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : G V L S F V V W L H H F F T M G S G A N V N A F F G I T T M I I S I P T G V K I F N W L F T M F R G R V H M T S P V L W T I G F I I T F S I G G M T G V M L A I P : 4 0 4

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : G V L S F V V W L H H F F T M G S G A N V N A F F G I T T M I I S I P T G V K I F N W L F T M F R G R V H M T S P V L W T I G F I I T F T I G G M T G V M L A I P : 4 0 4

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : G V L S F I V W L H H F F T M G S G A N V N A F F G I T T M I I S I P T G V K I F N W L F T M F R G R V H F T T P V L W T I G F M V T F V I G G M T G V M L A I P : 4 0 3

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : G V L S F L V W L H H F F T M G A G A N V N A F F G I M T M I I S I P T G A K V F N W L F T M Y R G R V E F S L P M L W T I G F M I I F V I G G M T G V L M A I P : 4 0 5

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : G V L S F L V W L H H F F T M G A G A N V N A F F G I M T M I I S I P T G A K V F N W L F T M Y R G R V E F S L P M L W T I G F M I I F V I G G M T G V L M A I P : 4 0 5

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : G V L S F L V W L H H F F T M G A G A N V N A F F G I M T M I I S I P T G A K V F N W L F T M Y R G R V E F S L P M L W T I G F M I I F V I G G M T G V L M A I P : 4 0 4

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : T I L A F V V W L H H F F T M G S G A N V N A F F G I A T M I I S I P T G V K I F N W L F T M Y K G R I R F T T P M M W T V G F L I T F T V G G M T G V L M A V P : 4 0 4

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : T I L S F I V W L H H F F T M G A G S N V N A F F G I T T M I I A I P T G V K I F N W L F T M Y Q G R V H M H S S M L W T I G F L I T F S I G G M T G V L L S I P : 4 0 4

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : T I L S F I V W L H H F F T M G A G A D V N T F F G I T T M I I A I P T G V K I F N W L F T I Y Q G R V H M H S S I L W T L G F L V T F S I G G M T G V L L S V P : 4 0 4

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : T A L S F C V W L H H F F T M G A G A N V N A F F G I M T M I I A I P T G V K I F N W L F T M Y R G K I I F Q S P M L W V I G F I V T F S I G G M T G V L L A V P : 4 0 4

L s F V W L H H F F T M G G a 1 V N a F F G I T M I I I P T G K 6 F N W L F T 6 5 G 4 6 p 6 6 W t 6 G F 6 6 F 6 G G M T G V 6 6 a 6 P

* 4 2 0 * 4 4 0 * 4 6 0 * 4 8 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : A V D F V L H N S L F L I A H F H N V I I G G V V F G Y L A G L T Y W F P K A F G F K L N E R L G K A S F W C W I I G F F V A F M P L Y V L G F M G M T R R M N T : 4 8 5

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : A V D F V L H N S L F L I A H F H N V I I G G V V F G Y L A G L T Y W F P K A F G F K L N E K I G K A S F W C W I I G F F V A F M P L Y V L G F M G M T R R M N T : 4 8 5

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : A I D F V L H N S L F L I A H F H N V I I G G V V F G M F A G I T Y W W P K M F G F R L N E F W G K C A F W C W F I G F Y V T F M P M Y V L G F M G M T R R L Q S : 4 8 4

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : A V S F V L H N S L F L V A H F H N T I I G G V V F G C I A G M V Y W F P K A F G F K L N E R L G K Y S F W C W F V G F F L T F T P M Y L L G F K G M T R R L N T : 4 8 6

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : A V S F V L H N S L F L V A H F H N T I I G G V V F G C I A G M V Y W F P K A F G F K L N E R L G R Y S F W C W F V G F F L T F T P M Y L L G F K G M T R R L N T : 4 8 6

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : A V S F V L H N S L F L V A H F H N T I I G G V V F G C I A G M V Y W F P K A F G F K L N E R L G K Y S F W C W F V G F F L T F T P M Y L L G F K G M T R R L N T : 4 8 5

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : G A D F V L H N S V F L I A H F H N V I I G G V V F G C F A A I T Y W F P K A T G F T M N E T W G K R A F Y L W I V G F L M A F L P L Y A L G F M G M T R R L S Q : 4 8 5

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : P A D F I L H N S L F L V A H F H N V I I G G V V F G C F A G I N Y W F P K L F G F I L N E L W G K R A F W F W I I G F F T A F M P L Y F L G F M G M T R R L S Q : 4 8 5

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : P A D F V L H N S L F L V A H F H N V I I G G V V F G C F A G I N Y W F P K L F G F V L N E I W G K R A F W F W I I G F F L A F I P L Y F L G L M G M T R R L S Q : 4 8 5

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : G A D F I L H N S L F L V A H F H N V I I G G V L F G C F S G I S Y W F P K A F G Y T L D E T W G K R A F W F W I I G F Y V A F M P L Y I L G F M G M T R R L S Q : 4 8 5

F 6 L H N S 6 F L 6 A H F H N I I G G V 6 F G a g 6 Y W 5 P K f G 5 6 1 E G 4 F 5 W 6 G F F P 6 Y L G f G M T R R 6

* 5 0 0 * 5 2 0 * 5 4 0 * 5 6 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : Y N H P E W A P W L Y V A A A G A A I I G L G I F L N L V Q I A Y S V W K R K D N M D H T G D P W D G R T L E W A T S S P P P F Y N F A V L P H I D D R - D Q F W : 5 6 5

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : Y N H P E W A P W L Y V A A V G A A I I G M G I F L N L V Q I G Y S V W K R K E H M D Y T G D P W D G R T L E W A T S S P P P F Y N F A V L P H I D D R - D Q F W : 5 6 5

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : T V N P A Y E P L L L I A A A G A F I V G A G I L C Q I I Q V A V S I R D R K K T V D L T G D P W D A R T L E W E T S S P P A F Y N F G T L P E V T E L - D D F W : 5 6 4

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : Y D N P E W Q P Y L L V A L V G A T L I M L G I F F L L Q Q V F V S I R D R K E N M D V T G D P W G G R T L E W S T S S P P P F Y N F A H V P H I D S L - D Q F W : 5 6 6

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : Y D N P E W Q P Y L L V A L V G A T L I M L G I F F L L Q Q V F V S I R D R K E N M D V T G D P W G G R T L E W S T S S P P P F Y N F A H V P H I D S L - D Q F W : 5 6 6

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : Y D N P E W Q P Y L L V A L V G A T L I M L G I F F L L Q Q V F V S I R D R K E N M D V T G D P W G G R T L E W S T S S P P P F Y N F A H V P H I D S L - D Q F W : 5 6 5

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : D I N P E Y F P L L A V A A A G T V V I A L G V L S Q F I Q I Y V S I R D R E Q N R D L T G D P W G G R T L E W A T S S P P P F Y N F A H L P K G D V L - D A F W : 5 6 5

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : N I D I E F H F L L S I A A I G A I L I G I G I L C Q I I Q F W V S V R D R H I N L D V T G D P W D G R T L E W S T S S P A P L Y N F A I I P H I K N K D D F W E : 5 6 6

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : N I D S E F H M L L C I A A I G A C F I G I G I I C Q V I Q F F I S I K E R R H N L D L T G D P W D G R T L E W S T S S P A P L Y N F A I I P K V E D R D D F W R : 5 6 6

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : Q I D T E F S P M L I T A A V G T I L I G C G I I C Q C L Q L I I S I R N R H H N L D K T G N P W N G F T L E W S T S S P P P F Y N F V N I P I I N N H R N I F W : 5 6 6

e 5 p L A G a 6 G 6 Q S 6 R n D T G 1 P W g r T L E W T S S P p p f Y N F a 6 P 1 5 w

* 5 8 0 * 6 0 0 * 6 2 0 * 6 4 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : G D K Q N G - K G W V R P S S Y E P I H M P R N T G A G V Y I A A F S V L L G F G L T W H I W W L A I I G L A G M I G S F I A R S F D D D I D Y W V P A E E V K R : 6 4 5

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : A D K Q N G - K G W V R P S K Y E A I H M P R N T G A G V Y I G A F S V L L G F G L I W H I W W L A I I G L V G M I G S F I A R T F D D D I D Y W V P A D E V E R : 6 4 5

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : E R K Q R G - E A W P K P A K Y T D I H M P R N T G T G V V I G A F S L V F G F A M I W H I W W L A I V G F V G M I A T F I Y R T F D Q D V D Y W V P A A E V E R : 6 4 4

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : E D K E N G - R A Y Q R P A K Y E D V H M P R N T A A G I Y I G A F G L A M S F G L I W H M W W L A I V G F L G M I V S F V V R S Y D R D V D Y Y V P A K E V E E : 6 4 6

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : E D K E N G - R A Y Q R P A K Y E D V H M P R N T A A G I Y I G A F G L A M S F G L I W H M W W L A I V G F L G M I V S F V V R S Y D R D V D Y Y V P A K E V E E : 6 4 6

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : E D K E N G - R A Y Q R P A K Y E D V H M P R N T A A G I Y I G A F G L A M S F G L I W H M W W L A I V G F L G M I V S F V V R S Y D R D V D Y Y V P A K E V E E : 6 4 5

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : Y Q K Q S G E F D P M K E V E Y E R I H M P K N T A T G I Y V S A W A L V F G F A M I W Y I W W L A A A S L V G I V V T C I Q H S Y N D D V D Y Y V E V E E I K A : 6 4 6

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : L K K Q K N Q - - - V Q K K Q Y S A I H M P K N T G L G I F I S F F S L L F G F S A V W N I I W L S F L S F L V V I I S L I F K S I D E N T E Y T V S V K E I E S : 6 4 4

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : N K E G Q H Y N K L I N S I N Y H D I H M P K N T G L G F M I S I F S L F F G F S A V W H I T W L C I L S F L A I I I S L F I N S L N E D T E Y T I S A E E I K K : 6 4 7

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : Y I K N N K N - I S C N I K K Y Q P I H M P K N T H E G I L I A F F S L I F G F S M I W Y I W W S A I L G F F G I I I T W I A R S F N T N T E Y Y I T P K E I K E : 6 4 6

k Y 6 H M P 4 N T G 6 5 6 F W 6 w W l a i g 6 6 3 3 1 1 Y 6 E 6

* 6 6 0 * 6 8 0

N P _ 6 3 6 5 3 4 . : I E D A R F A K L E Q Q H A A Q A A K A I - - - - - - - - - - - : 6 6 6

A A M 3 6 1 3 0 . 1 : I E N A R F A L L E Q Q Q A A Q A A K V V - - - - - - - - - - - : 6 6 6

A A P 2 2 9 4 9 . 1 : I E N E H R K H L E A Q G L V K S E L K A - - - - - - - - - - - : 6 6 5

N P _ 8 8 3 3 8 8 . : I E N A Y F G K L Q Q K A A - - - - - - - - - - - - - - - - - - : 6 6 0

N P _ 8 8 7 8 3 0 . : I E N A Y F G K L Q Q K A A - - - - - - - - - - - - - - - - - - : 6 6 0

N P _ 8 8 1 5 1 4 . : I E N A Y F G K L Q Q K A A - - - - - - - - - - - - - - - - - - : 6 5 9

N P _ 8 0 0 1 3 8 . : I E A A R R A Q L E E A K K G T V K D N E N S D D L E V T Y A N : 6 7 8

N P _ 6 6 0 7 8 7 . : I E N R H L E N V Q K A G L K - - - - - - - - - - - - - - - - - : 6 5 9

N P _ 2 4 0 2 8 2 . : I E H Q Y W K N I Q K A G L K - - - - - - - - - - - - - - - - - : 6 6 2

N P _ 8 7 8 5 4 1 . : I E Y N A Y N K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - : 6 5 4

I E

Консервативные остатки на 100% показаны красным цветом; консервативные более, чем на 80% — синим.

Изображение 3D-структуры белка CYOB_ECOLI с отмеченными консервативными остатками

Изображение создано с помощью программы RasMol. Белок показан в остовной модели, а лиганд гем — в шариковой модели. Остатки в зоне контакта представлены в виде шарнирных моделей. Консервативные остатки выделены цветом:

консервативные на 100% — зелёным
консервативные более, чем на 80% — красным
консервативные менее, чем на 80% — таких нет.

Как видно из приведённого изображения лиганда гема из белка CYOB_ECOLI с консервативными аминокислотными остатками в районе пяти ангстрем от лиганда подавляющее большинство остатков консервативны на 100%. Лишь остатки ALA 502 (заменяется на треонин, довольно далёк от гема) и PHE 103 (близок к лиганду, лишь в ортологичной последовательности NP_878541 заменен на валин) консервативны на 80%. Данные результаты говорят о редкости происхождения мутации вблизи функционального лиганда, которые могли привести к потере белком его функции (участвует в аэробном метаболизме) и зона контакта, что естественно, более консервативна, чем белок в среднем. Но стоит обратить внимание, что последовательности были взяты слишком близкие (у некоторых процент сходства более 90%), так что однозначно судить о консервативности области связывания лиганда нельзя.

Второй семестр