Филогенетическое дерево

Отобранные бактерии:

Название	Мнемоника
Lactococcus lactis subsp. cremoris	LACLM
Lactobacillus acidophilus	LACAC
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus	LACDA
Listeria monocytogenes serovar 1/2a	LISM0
Geobacillus kaustophilus	GEOKA
Bacillus anthracis	BACAN
Bacillus subtilis	BACSU

Скобочная формула дерева:

((LACLM, (LACAC, LACDA)), (LISM0, (GEOKA, (BACAN,BACSU))));

Изображение дерева (программа MEGA):

Таксономия

1) LACLM: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Lactococcus; Lactococcus lactis; Lactococcus lactis subsp. cremoris

2) LACAC: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus; Lactobacillus acidophilus

3) LACDA: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus; Lactobacillus delbrueckii; Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus

4) LISMO: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Listeriaceae; Listeria; Listeria monocytogenes; Listeria monocytogenes serotype 1/2a

5) GEOKA: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Geobacillus; Geobacillus thermoleovorans group; Geobacillus kaustophilus

6) BACAN: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus cereus group; Bacillus anthracis

7) BACSU: cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus subtilis group; Bacillus subtilis

Теперь подпишем ветви, соответствующие таксонам

Чтобы получить изображение я:

1) Нарисовала дерево ручкой на бумаге.

2) Создала файл со скобочной формулой (файл с расширением .tre)

3) Открыла файл программой MEGA.

Нетривиальные ветви дерева:

{LACAC, LACDA} против {LACLM, LISMO, GEOKA, BACAN,BACSU}

{LACAC, LACDA, LACLM} против {LISMO, GEOKA, BACAN,BACSU}

{LACAC, LACDA, LACLM, LISMO} против {GEOKA, BACAN,BACSU}

{LACAC, LACDA, LACLM, LISMO, GEOKA} против {BACAN,BACSU}

Мы называем ветвь нетривиальной, если она разбивает множество листьев на подмножества, в каждом из которых более одного элемента.