KEGG

1. Референсный путь map00710:

2. Картинка пути с отмеченной цветом выбранной реакцией R01056:

3. Формула реакции:

4. Реакция представляет из себя превращение (изомеризацию) рибозо-5-фосфата (C00117) в рибулозо-5-фосфат (C00199) при участии фермента 5.3.1.6. Данная реакция встречается еще в 6 референсных метаболических путях, она относится к классу реакций - RC00434

5. Описание функции фермента, исходя из номера:

5. Изомераза

5.3. Внутримолекулярные оксидоредуктаза

5.3.1. Взаимопревращающиеся альдозы и кетозы и родственные им соединения

5.3.1.6. Порядковый номер фермента в данном под-подклассе

6. Метаболический путь Oryza sativa japonica (Japanese rice):

Метаболический путь Solanum lycopersicum (tomato):

Можно заметить, что и у томата, и у японского риса встречаются одни и те же ферменты, обеспечивающие данный метаболический путь.

7. Для Solanum lycopersicum в базе данных KEGG описано 25613 генов, кодирующих белки, и 708 генов, кодирующих РНК. Число метаболических путей описанных для томата: 323 .