Мембранные белки

Коннексин 26 (5ERA)

Коннексин 26 является трансмембранным белком из семейства белков щелевых контактов коннексинов. Эти белки образуют потенциалзависимые межклеточные каналы, обеспечивая функционирование электрического синапса путём пропускания инов через мембрану. На рисунке ниже изображен электрический синапс:

Рисунок 1

Об элетрическом синапсе нам рассказывали на лекциях по ФЧЖ. Мне стало интересно, как выглядит белок за счет которого возможна быстрая передача ПД от одной клетки к другой в организме человека. Структура коннексина 26 выглядит следующим образом (для визуализации расположения белка в мембране я использовала RCSB PDB):

Рисунок 2

Белок образует центральную пору, через которую и осуществляется диффузия ионов. Создается впечатление, что внеклеточные структуры белка практически отсутствуют.

Для того, чтобы предсказать трансмембранные участки белка я использовала сервис TMHMM.

Рисунок 3

По схеме видно, что белок имеет 4 трансмембранных участка, то есть он пронизывает мембрану 4 раза. При этом его внутриклеточные части приблизительно равны по размеру внеклеточным, а значит структура на рисунке 2 не совсем корректна, видимо, изображение, было неудачно обрезано.