Информация о белке с идентификатором NP_560184.1 и его гене, полученная из записи NC_003364 базы данных RefSeq с полным геномом бактерии, приведена в таблице 3. На рис. 3 изображена окрестность в геноме гена описываемого белка.
Рис. 1 Окружение белка с идентификатором NP_560184.1 из археи Pyrobaculum aerophilum str. IM2. Рисунок содержит ген NP_560184.1 и соседние к нему NP_560185.1 и NP_560183.1 Pисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
Описание: Исходный ген NP_560184.1 с координатами 1,595,777..1,596,772 находится на обратной цепи ДНК. Ген, кодирующий белок, NP_560185.1 с координатами 1,596,769..1,597,68 находится на по направлению от 5' к 3' концу от NP_560184.1, перекрывание на 3 нуклеотида, рамка считывания +1 (т. к. находится на той же цепи, что и ген NP_560184.1). Ген NP_560183.1 с координатами 1,595,400..1,595,780 находится по направлению от 3' к 5' концу от от NP_560184.1, перекрывание на 3 нуклеотида, рамка считывания +1. Я думаю, что все эти три гена могут находиться в одном опероне.
Табл. 1. Основные свойства гена, кодирующего белок NP_560184.1 из генома организма Pyrobaculum aerophilum IM2
|
Вид информации |
Квалификатор в записи генома |
Значение |
|
/locus_tag |
... |
|
|
/gene |
... |
|
|
/db_xref="GeneID... |
1464707 |
|
|
— |
1595777 |
|
|
— |
1596772 |
|
|
— |
Обратная |
|
|
— |
996 |
|
|
/protein_id |
NP_560184.1 |
|
|
— |
221 |