A picture of DNA should be here

Изучение файла структурных факторов РСА эксперимента

Для восстановления структуры алкогольдегидрогеназы из Pyrobaculum aerophilum был проведен РСА эксперимент, результатом которого является набор структурных факторов. Из экспериментальных данных была восстановлена структура белка (PDB: 4JBI). Файл со структурными факторами можно найти здесь.

Файл с рефлексами, содержит индексы измеренных рефлексов (_refln.index_h _refln.index_k _refln.index_l), информация, какие рефлексы использовались для оптимизации модели (_refln.status), среднее значение измеренных амптитуд для каждого рефлекса(_refln.F_meas_au) и их стандартное отклонение ( _refln.F_meas_sigma_au).

В таблице предложен файл со структурными факторами, но в формате .xlsx. Из 254967 использованных для построения электронной плотности значений 89% (226559 рефлексов) имеют достаточную силу сигнала, то есть превышают среднеквадратичное отклонение в 3 или более раз. Для оптимизации модели использовано - 95% (241887 рефлексов). Среди пропущенных троек: (-55;0;19), (-25;0;62); (4;0;0); (4;0,2); (2;1;1); (22;27;8)

Во-первых, амплитуды рефлексов могут быть утеряны из-за наличия заглушки в направлении первичного пучка рентгеновских лучей, а также из-за технических ограничений эксперимента.