Выравнивание последовательностей белка. Pr10

Таблица 1. Характеристики двух лучших выравниваний полипротеина вируса полиомиелита и полипротеина вируса ящура

ID	AC	Score (B)	% Identity	% Positive	% Gaps	Site length	Mature proteins
POLG_FMDV1 POLG_POL1M	P03306 P03300	638 (250)	29	48	8	644 615	Picornain 3C, RNA-directed RNA polymerase 3D-POL Protease 3C, RNA-directed RNA polymerase
POLG_FMDV1 POLG_POL1M	P03306 P03300	397 (157)	37	51	9	263 277	Protein 2C Protein 2C

Карта локального сходства полипротеина вируса полиомиелита и полипротеина вируса ящура

Graph

Таблица 2. Сравнение веса выравнивания со случайным у гомологичных и негомологичных белков

H/NH	ID	Score	Median	Q₁	Score (B)	p
Homologous	AROC_BACSU AROC_ECOLI	518.5	50.75	55.25	104.83	2×10^-31
Nonhomologous	AROC_BACSU ENO_BACSU	71	61.25	68.5	2.35	2^-2

Таблица 3. Характеристика выравнивания гомологов AMA61679 из банка SW (BLAST)

ID	AC	Organism	% Identity	% Positive	Site length	% Gaps	Score (B)	Expect	% Coverage
BJAI_BRADU	Q89VI2	Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 110	91	96	219	0	1078 (419)	1×10^-150	100
RPAI_RHOPA	Q6NCZ6	Rhodopseudomonas palustris CGA009	43	62	177	2	374 (148)	1×10^-43	81.19

© Бруман Софья, 2018