Геномные браузеры

Упражнение 1. UCSC

Для данного упражнения был выбран белок Ku70, который кодируется геном XRCC6.
Короткое имя гена: XRCC6
Полное имя гена: X-ray repair cross complementing 6
Цепь, на которой ген закодирован: +
Хромосома, где находится: 22
Плечо и полоса, к которым пренадлежит участок: 22q13.2
Координаты гена в последовательности хромосомы: chr22:41621119-41664039
Количество альтернативных продуктов, закодированных в гене: 6
Например: ENST00000360079.7 - 13937 а.о, 13 экзонов; ENST00000428575.6 - 13924 a.o, 12 экзонов; NST00000402580.7 - 13937 а.о, 13 экзонов;

default

Упражнение 2. Ensembl

Выравнивание с гомологичным геном шимпанзе
Distmat показал 1.01 замены на 100 нуклеотидов, значит количество замен равно 433. По данным Ensembl, всего в гене 65701 полиморфизмов.