| короткое имя гена | CTNNB1 |
|---|---|
| полное имя гена | ENSG00000168036.18 |
| цепь | + |
| хромосома | chr3 |
| плечо и полоса | chr3:p22.1 |
| координаты гена в последовательности хромосомы (по данным RefSeq) | 41199451-41240448 |
| альтернативных продуктов | 39 |
| Название продукта | Число экзонов | Длина аминокислотной последовательности | Координаты |
|---|---|---|---|
| ENST00000643541.1 | 16 | 781 | 41,194,741-41,239,949 |
| ENST00000645210.1 | 16 | 781 | 41,194,848-41,239,970 |
| ENST00000646381.1 | 17 | 774 | 41,194,853-41,239,900 |
По указаниям на сайте было получено выравнивание
ссылка на выравниваниеДалее я воспользовалась пакетом EMBOSS. команда:
infoalign -html -only -name -seqlength -gapcount -diffcount -heading -alignlength human_chimp_al.fasta -out v1.infoalignрезультат:
| Name | Sequence Length | Aligned Length | Gap Length | Difference |
|---|---|---|---|---|
| homo_sapiens_1-65730 | 65356 | 65730 | 374 | 0 |
| pan_troglodytes_1-65730 | 65442 | 65730 | 288 | 737 |
Нужно нажать на "Go to Region in Detail..." и там слева и правда будет
ссылка на NCBI.