12. Метаболические пути - KEGG

1. Картинка референсного пути. Это синтез тетрациклина!

2. Картинка пути (или фрагмент) с отмеченной цветом выбранной вами реакцией
REACTION: R11516

3. Формула реакции
Очень забавная реакция, в которой соединяются 8 молекул малонил-коА (из цикла Кребса) к малонамилу (соединенному правда с белком-переносчиком). В итоге отсоединяется 8 кофакторов, углекислый газ и получается длинная цепоска с кучей кислородов. (потом она "согнется" пополам, замкнутся циклы, немного уличной магии и получится тетрациклин)

4.Фермент. катализирующий реакцию
minimal PKS ketosynthase (KS/KS alpha) - ORTHOLOGY: K05551 5. Функции на основе номенклатурной нумерации
[EC:2.3.1.- 2.3.1.260 2.3.1.235] 2 - Трансферазы (КФ2) — отдельный класс ферментов, катализирующих перенос функциональных групп и молекулярных остатков от одной молекулы к другой.
2.3 — переносящие ацильные остатки (ацилтрансферазы);
2.3.1 Ацилтрансферазы, переносящие не амино-ацильные группы
6. Два разных организма и пути в них

7. Для любого из выбранных вами организмов укажите: число метаболических путей, число генов

T01648   
GENOME: Kitasatospora setae 
Number of protein genes:        7569
Number of RNA genes:             104

Pathway (308)   
   KEGG PATHWAY (131)

8. (*) Для двух выбранных организмов укажите число общих метаболических путей. Выполние задание с помощью KEGG API. Опишите ваши действия 9. (*) Возьмите список ID из прошлого задания, посмотрите обогащение KEGG путями (STRING)