13. Transmembrane proteins

Ну, сдавала я однажды Зернову коллок по курсу Высших растух. Когда Ваш семинарист на самом деле не семинарист, а лектор, то хоть коллок сдаете вроде Вы, но стоит замолчать больше чем на секунду, то неожиданно обнаруживаете, что вставить слово у Вас уже нет никакой возможности. Так что в ходе такого вот (не) моего рассказа о синтезе клеточной стенки, зашла речь о розетке - крупном комплексе синтеза целлюлозы. И поразило это все мое воображение. (чтож, цель коллоквиума достигнута)
Disclaimer - вообщето, той самой розетки (6-и частного комплекса, который скользит по мембране, откладывая наружу упорядоченные ленты целлюлозы), я так и не смогла найти, поэтому пришлось рассматривать бактериальную целлюлозо-синтазу. Но пишут, что комплексы похожи на самом деле.
Итак, компекс состоит из двух частей - BcsA - каталитический, со стороны цитоплазмы, и BcsB - регуляторный, в периплазме. Вместе они формируют трансмембранный канал, через который синтезируемая цепочка целлюлозы выходит из клетки. Еще со стороны цитоплазмы у комплекса есть "ворота", загораживающие вход в канал в неакивном состоянии. Стимуляция происходит при помощии цикло-ди-ГМФ, который разрушает один солевой мостик, меняется конформация - "ворота" отходят - и может начаться синтез
Ссылка на последовательность белка

image
Это обработка для А-цепи. Интересно, что именно она большей частью заякоривается в мембране. Видно 8 спиралей. Также (много розововго) предсказываеся, что большая часть белка - внутри, со стороны цитоплазмы.
image
Это B-цепь. Видно, что у нее заякоривание только благодаря всего одной спирали. Видим что большинство белка покрашено синим - то есть предсказывается, что он находится снаружи. Это совпадает с данными. Суммарно на самом деле и предсказались те 9 спиралей, что получены из кристализации.

Ссылка на запись в RSCB А вот офигенная картинка. Можно сочитать 9 спиралей. Показан Cyclic di-GMP image