Дерево в строчном формате newick
(((STRP1, ENTFA), (LISMO, (GEOKA, BACAN))), (MOOTA, CLOBA));
Выполнено maximum liklelihood с применением bootstrap анализа
(((((((CLPX_GEOKA,CLPX_BACAN),CLPX_LISMO),CLPX_ENTFA),CLPX_MOOTA),CLPX_CLOBH),(Q2RJP5_MOOTA,(HSLU_ENTFA,HSLU_LISMO,(HSLU_GEOKA,HSLU_BACAN)))),(Q8Y8B1_LISMO,M4YWY5_STREQ,(M4YZ72_STREQ,Q5L436_GEOKA)),Q2RLR4_MOOTAQ5KUR3_GEOKA,Q5KZ67_GEOKA,Q2RLP6_MOOTA,(A5I501_CLOBH,(Q2RJJ8_MOOTA,(A5HYU4_CLOBH,(A5I766_CLOBH,(A5I7Q0_CLOBH,Q2RM95_MOOTA,((Q8YAC6_LISMO,Q5L3T1_GEOKA),(M4YVJ8_STREQ,Q839B1_ENTFA))))))));;
Паралоги: CLPX_GEOKA + HSLU_GEOKA; A51766_CLOBH + CLPX_CLOBH; Q2RLR4_MOOTA + Q2RM95_MOOTA
Ортологи: CLPX_LISMO + CLPX_BACAN; HSLU_ENTFA + HSLU_LISMO; M4YVJ8_STREQ + Q839B1_ENTAFA
ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX (ClpP protease comlex - формирует эндопептидазу - a chaperone. СlpX - компонент, разворачивающий
третичную структуру белков с затратой АТФ)
Есть для 6 из 7 видов, нет для SSTREQ. Дерево полностью соответствует настоящему.
ребят.
АTP-dependent protease ATPase subunit HslU. Тоже шаперон, имеющий
АТФ-зависимую субъединицу из ААА АТФаз.
Есть для 5 бактерий (всез без CLOBH и STREQ). Дерево немного отличается.
Для BACAN GEOKA LISMO MOOTA все верно, а вот ENTFA и LISMO на настоящем дереве
не объединены.
ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH. Играет роль в контроле качества
интегральных мембранных белков.
Для всех видов, кроме BACAN. Дерево полностью соответствует пнастоящему поддереву для данных видов