Meet the protein: 4-alpha-glucanotransferase 

>gi|384477540|gb|AFH91336.1| 4-alpha-glucanotransferase [Corynebacterium pseudotuberculosis 31]
MGYTELLRELAAAHAVSCSFTGFGGEVTEVSDDTLVKTLRALGVRFGNEPEDSPNDHMPLDAPMPSEEQI
RAAIQKRRDEEDTRPLPRCVVATQGDPYVFNVHVHDGSPADITITLEDGSVAADVTQIENWTPPRTVDGI
TWGEASFQIPQDLPLGWHTITLTSDTLTASCFLIITPQQLSTARTFVENPATGVMAQLYSVRSNDSWGMG
DFHDLGELAKVVADKADADYILVNPMHAAEPFPPVEDSPYLPTTRRFINPIYIRVEDIPEYLSLNDELQK
EIEEISSEFKALNHSSDKIERNPIYDAKLQVLHAIFEAERDPAREQDFRDFVASEGDGLYDFALWCADQE
IAHLTASSSHAAIPAPEEAAEFYMWLQWICDQQLGAAQSAAIDAGMSIGIIADLAVGIHPGGADAQSLAD
SLAPRASVGAPPDNYNQQGQNWSQPPWHPDRLAEASYVPWRDLLRTVLRHAGGIRVDHILGLFRLFWIPR
MQSPTTGAYVNYDHNALVGVLALEAERAGAVVIGEDLGTYEPWVQEFLAQRGIMGTSVLWFESSPTGGPR
HQNEYRELALSSVTTHDLPPTAGLLAGEHIELRKELGILTVDPEQEHEQDIRWQNEILDEVKHTGAFSGA
TVPETFQGLNREERGSADTLIPAIHKFLAGTPSALTCTSLVDLVGDRRAQNQPGTTSDMYPNWCIPLCDG
NIQALTIEEIADLPLFQAVADASKRNKR

В таблице один указаны некоторые важные характеристики данного белка:

Данные взяты из соответствующего места полного генома бактерии в FASTA формате.
Эта информация была любезно предоставлена нам базой данных NCBI.

Таблица 1. Описание 4-альфа-глюканотрансферазы из генома бактерии Corynebacterium pseudotuberculosis 31

Параметр Значение

Идентификатор белка

AFH91336.1

Идентификатор генома

CP003421

Координаты гена в геноме

1725953..1728139

Длина гена(b.p.)

2187

Цепь

Прямая

Длина белка

729 ам.к-ных остатков

 

CDS             1725953..1728139
                     /gene="malQ"
                     /locus_tag="Cp31_1531"
                     /codon_start=1
                     /transl_table=11
                     /product="4-alpha-glucanotransferase"
                     /protein_id="AFH91336.1"

Геномное окружение белка 4-альфа-глюканотрансферазы:

Заметим, что интересующий нас белок обозначен как malQ
Ссылки на источники:
  1. NCBI
Вернуться назад.

©Solonovich Vera,2016