Описание пространственной структуры белка RHO_ECOLI по данным банка PDB, код 1a8v

На рисунке слева изображена теоретическая модель белка RHO_ECOLI. Мы можем видеть две цепочки — красная и жёлтая, соответственно, α-цепь и β-цепь. Они одинаковые по аминокислотному составу. В положении 119 на конце каждой цепи располагаются небелковые части — это ионы меди.

background white backbone 100 wireframe off select *A color yellow select *B color red select [CU] cpk 400 color grey label %e select gly-1 color purple wireframe 70 select his0 color purple wireframe 70 select glu47 color purple wireframe 70 select gly-1:A.N cpk 100 color structure label %e select his0:A.N cpk 100 color structure label %e select his0:A.ND1 cpk 100 color structure label %e select glu47:B.OE1 cpk 100 color structure label %e select glu47:B.OE2 cpk 100 color structure label %e select gly-1:B.N cpk 100 color structure label %e select his0:B.N cpk 100 color structure label %e select his0:B.ND1 cpk 100 color structure label %e select glu47:A.OE1 cpk 100 color structure label %e select glu47:A.OE2 cpk 100 color structure label %e zoom 500

Этот скрипт создан для исследования белка RHO_ECOLI в программе RasMol. С его помощью можно не только увидеть наглядно, что белок составлен из двух цепей, но и как эти цепочки удерживаются друг подле друга. Для просмотра в RasMol'e скопируйте скрипт в директорию на вашем компьютере, сохраните. Далее откройте программу RasMol, где в командной строке напишите: "script <адрес директории>" и нажмите <Enter>.