Назад

Описание документа InterPro.

PfamPF07498Rho_N187

Здесь указаны название БД, идентификатор, имя подписи и число белков.

Описание всех известных подписей в белка RHO_ECOLI, собранные в БД.

Название подписиПоложение в последовательности RHO_ECOLIПолное название базы данных
ATP-synt_ab157-365Pfam
AAA170—355Smart
rho1—418TIGRFAMs
Nucleic_acid_OB48—125Superfamily
Rho_N5—47Pfam
Rho_RNA_bind49—126Pfam
CSP52—118Smart

Отношение родства используются для того, чтобы правильно идентифицировать взаимотношения в семье/подсемействе белка. Если InterPro показывает, что "родительская" запись имеет более одной "дочерней" записи, то аминокислотная последовательность белка не может быть найдена в графе Matches в большем числе "дочерних". Если одна запись InterPro описана как "дочерняя" другой, то эта "дочерняя" является более специфичной. Подписи для "родительской" и "дочерней" записей должны наложиться, что и показано на рисунке:

Отношение родства может быть показано через генеалогическое дерево. Но вот у меня оно даже на деревце не похоже:

Идентификатор документа InterPro, содержащий родительскую запись, — IPR011129.

Расположение мотивов в белке RHO_ECOLI


© Бурлин Антон, 2005