Назад

Консервативные аминокислотные остатки

Множественное выравнивание:

                                                                                                                                       
                                          *                 2 0                   *                 4 0                   *            
R H O _ E C O L I   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ N E I G O   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R H O S H   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R I C P R   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T R E P A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ H E L P J   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B O R B U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ A Q U A E   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T H E M A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B A C S U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ S T R L I   :   M S D T T D L M G A R V E E T A A A P A T D A S A P A T G A G S R R R R G T G L E G M V L A E L Q Q   :     5 0
                                                                                                                                       
                                                                                                                                       
                                        6 0                   *                 8 0                   *               1 0 0            
R H O _ E C O L I   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ N E I G O   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R H O S H   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R I C P R   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T R E P A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ H E L P J   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B O R B U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ A Q U A E   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T H E M A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B A C S U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ S T R L I   :   V A S G L G I R G T A R M R K S Q L I E V I K E A Q A A G G A P A K A A P A A A D T A G E T K P K R   :   1 0 0
                                                                                                                                       
                                                                                                                                       
                                          *               1 2 0                   *               1 4 0                   *            
R H O _ E C O L I   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ N E I G O   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R H O S H   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R I C P R   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T R E P A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ H E L P J   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B O R B U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ A Q U A E   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T H E M A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B A C S U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ S T R L I   :   R S T S R T R T G D E A P A E K A E K A G K A D K K A D K A A A D K A A A Q Q Q I E I P G Q P T P K   :   1 5 0
                                                                                                                                       
                                                                                                                                       
                                      1 6 0                   *               1 8 0                   *               2 0 0            
R H O _ E C O L I   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ N E I G O   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R H O S H   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R I C P R   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T R E P A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M K V S V G T V V G Q G E L G L E E G   :     1 9
R H O _ H E L P J   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B O R B U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M D K K N G G F D L E S E I R R L D   :     1 8
R H O _ A Q U A E   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T H E M A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B A C S U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ S T R L I   :   V N A S A E Q A A P A D D A P S E R R R R R A T S D A G S P S A T D T T V A V E T R A E P K A D T S   :   2 0 0
                                                                                                                                       
                                                                                                                                       
                                          *               2 2 0                   *               2 4 0                   *            
R H O _ E C O L I   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ N E I G O   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R H O S H   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ R I C P R   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T R E P A   :   I V G N Q I V S E D S A A D V G E C D A Y G G R K K L V I R S R S R R R V V T P K A L E V E K R P R   :     6 9
R H O _ H E L P J   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B O R B U   :   V S K E F K I E D N L K K K V V K V V A K K D S A S S V T K S A D L S G V K D S N G V I F S D F D Y   :     6 8
R H O _ A Q U A E   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ T H E M A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ B A C S U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R H O _ S T R L I   :   A P Q Q S Q G H Q Q G Q G D A R S D A E G G D G R R R D R R D R G D R D R G D R G D R G D R G D R G   :   2 5 0
                                                                                                                                       
                                                                                                                                       
                                      2 6 0                   *               2 8 0                   *               3 0 0            
R H O _ E C O L I   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M N L T E L K N T P V S E L I T L G E N   :     2 0
R H O _ N E I G O   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M H V S E L Q T L H I S K L L E L A E E   :     2 0
R H O _ R H O S H   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M N E R L N L A D L K A K T P A D L L A M A E E   :     2 4
R H O _ R I C P R   :   - M N T T N K Q L T E E L N N T E S N N D H N D F A E N N I I N L K Q L K R K L P E E L Q V Q A E E   :     4 9
R H O _ T R E P A   :   R A L R F K Q N F C P E D A E T S E S S A D V K G R A R L L I D D L T E M G M H A L R D F A V Q R G   :   1 1 9
R H O _ H E L P J   :   - - - - - - - - M N E N A P T H K S S H K V K T H T P V S G Y H I E D L R T Y P T E K L L E I A N K   :     4 2
R H O _ B O R B U   :   D I P S S G L E N N I K T L E Q S N I I K F F N G K D Y V E I E K L Y D K P I T E V R K I V E G L G   :   1 1 8
R H O _ A Q U A E   :   - - - - - - - - - - - - - M T Q Q T A Q Q E Q Q K S E V K I Y S R E E L K Q K T L A E L Q K I G K E   :     3 7
R H O _ T H E M A   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M S E E Q K T I S I S E L E S M N I K Q L Y E I A K S   :     2 7
R H O _ B A C S U   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M K D V S I S S L E N M K L K E L Y E L A R H   :     2 3
R H O _ S T R L I   :   D R G E R G R D R R N K G D D Q Q N Q G G G R Q D R Q Q Q G G G G R Q D R Q Q H D D G Y D D D G S G   :   3 0 0
                                                                                                                                       
                                                                                                                                       
                                          *               3 2 0                   *               3 4 0                   *            
R H O _ E C O L I   :   M G L E N L A R M R K Q D I I F A I L K Q H A K S G E D I F G D G V L E I L Q D G F G F L R S A D S   :     7 0
R H O _ N E I G O   :   H G I E N A N R F R K Q D L V F A I V R Q M M K K G E G F T C S G T L E I L P D G F G F L R S A D T   :     7 0
R H O _ R H O S H   :   W E I E N A P S M R K G E M M F S I L K E H A E E G Y E V G G D G V L E V L Q D G F G F L R S P E A   :     7 4
R H O _ R I C P R   :   L K I E N I S S L L K Q E L V F A I L K K S V E Q G G L I V G E G V L E V L P D G F G F L R S P E V   :     9 9
R H O _ T R E P A   :   I S Q E D V V V M K K S D I I F H V L K N H T E N G G V I F A S G S L E I L P D G Y G F L R S P Q N   :   1 6 9
R H O _ H E L P J   :   L K V E N P Q E F K R Q D L M F E I L K T Q V T Q G G Y I L F T G I L E I M P D G Y G F L R G F D G   :     9 2
R H O _ B O R B U   :   T N H T I A V T M K K T E L I F L L V K I L S E N N I D V L F T G V L D V L S D G Y G F L R T A S N   :   1 6 8
R H O _ A Q U A E   :   L G L T R T T G L K K E E L I E K I L K A Q L E K S R L V F V K G V L E I L P E G Y G F L R M P E N   :     8 7
R H O _ T H E M A   :   L G I P R Y T S M R K R D L I F A I L K A Q T E S T G Y F F G E G V L E I H P E G F G F L R R I E D   :     7 7
R H O _ B A C S U   :   Y K I S Y Y S K L T K K E L I F A I L K A N A E Q E D L L F M E G V L E I I Q S - E G F G F L R P I   :     7 2
R H O _ S T R L I   :   R R G R R G R Y R D R R G R R G R D E I Q E P Q I N E D D V L I P V A G I L D I L D N Y A F I R T S   :   3 5 0
                                            k         f       k                         g   l e         g   g f l r                    
                                                                                                                                       
                                      3 6 0                   *               3 8 0                   *               4 0 0            
R H O _ E C O L I   :   S Y L A G P D D I Y V S P S Q I R R F N L R T G D T I S G K I R P P K E G E R Y F A L L K V N E V N   :   1 2 0
R H O _ N E I G O   :   S Y L A G P D D I Y V S P T Q I R R F N L H T G D T I E G S V R V P K D N E R Y F A L V R L D S I N   :   1 2 0
R H O _ R H O S H   :   N Y L P G P D D I Y V S P E I L R Q F S L R T G D T I E G V I V A P R E N E R Y F S L T R V T K I N   :   1 2 4
R H O _ R I C P R   :   N Y L A G P D D I Y I S P S Q I R R F G L R T G D T V E G Q I R A P K A G E R Y F A L L K V N R V N   :   1 4 9
R H O _ T R E P A   :   S Y L P G S D D I Y V S P S Q I R L F N L K T G D T I Y G Q I R S P K E G E R F F A M L R V E T V N   :   2 1 9
R H O _ H E L P J   :   S F S D G H N D T Y V S P S Q I R R F A L R N G D I V T G Q V R S P K D Q E K Y Y A L L K I E A I N   :   1 4 2
R H O _ B O R B U   :   S Y L S G G N D V Y V S P S Q I R L F N L R T G D I L Y G Q I R S P R D G E R F F A M V K I K S I N   :   2 1 8
R H O _ A Q U A E   :   N Y M P S W N D V Y V A P S Q I K K F G L R T G D T I E G F A R L P R E N E K Y K A L I R M E S V N   :   1 3 7
R H O _ T H E M A   :   N L L P S N D D I Y I S P S Q I R K F N L N T G D I I S G V I R K P K E G E K Y F A M I K I E A I N   :   1 2 7
R H O _ B A C S U   :   N Y S P S S E D I Y I S A S Q I R R F D L R N G D K V S G K V R P P K E N E R Y Y G L L H V E A V N   :   1 2 2
R H O _ S T R L I   :   G Y L P G P N D V Y V S L A Q V R K N G L R K G D H L T G A V R Q P K E G E R R E K F N A L V R L D   :   4 0 0
                          y           D   Y   s p   q i r   f   L     G D       G     r   P       E                       n            
                                                                                                                                       
                                          *               4 2 0                   *               4 4 0                   *            
R H O _ E C O L I   :   - - - F D K P E N A R N K I L F E N L T P L H A N S R L R M E R G N G - - S T E D L T A R V L D L A   :   1 6 5
R H O _ N E I G O   :   - - - G D H P E V C R H K I L F E N L T P L F P T E Q L K L E R D L K - - S E E N L T G R A I D L I   :   1 6 5
R H O _ R H O S H   :   - - - F D D P E R A R H K V H F D N L T P L Y P D E R L K M E V D D P - - T M K D R S A R I I D L V   :   1 6 9
R H O _ R I C P R   :   - - - F E D P A K A Y H R V H F D N L T P L Y P D E K L G L E L E N N S K D S K D F S T R V I E L V   :   1 9 6
R H O _ T R E P A   :   - - - F E E V A K V Q D R V P F D S L T P L Y P R E K L N L E T R T E - - - - - D I S T R V M N L F   :   2 6 1
R H O _ H E L P J   :   - - - Y L P S D E I K N R P L F D N L T P L F P D E Q I K L E Y E P T - - - - - K V T G R M L D L F   :   1 8 4
R H O _ B O R B U   :   - - - D Q D P T F A Q N R I P F D N L T P L Y P N V K L N L E Y E N C N - - - - - I S T R L I N L F   :   2 6 0
R H O _ A Q U A E   :   G L - P P D P E I L K R R P Q F E K L T P L H P M E R F K L E Y D P N - - - - - E L S T R V V S L I   :   1 8 1
R H O _ T H E M A   :   - - - Y R P V E A V N D R V N F D N L T P D Y P R E R F I L E T D P K - - - - - I Y S T R L I D L F   :   1 6 9
R H O _ B A C S U   :   - - - G D D P E S A K E R V H F P A L T P L Y P D R Q M V L E T K P N - - - - - F L S T R I M D M M   :   1 6 4
R H O _ S T R L I   :   S V N G M A P E H G R G R P E F N K L T P L Y P Q D R L R L E T D P G - - - - - V L T T R I I D L V   :   4 4 5
                                                      F     L T P l   p           l E                           R       l              
                                                                                                                                       
                                      4 6 0                   *               4 8 0                   *               5 0 0            
R H O _ E C O L I   :   S P I G R G Q R G L I V A P P K A G K T M L L Q N I A Q S I A Y N H P D C V L M V L L I D E R P E E   :   2 1 5
R H O _ N E I G O   :   S P I G K G Q R A L L V A P P K I G K T V M L E N I A H E V T A N Y P E V E L I V L L I D E R P E E   :   2 1 5
R H O _ R H O S H   :   A P I G K G Q R G L I V A P P R T G K T V L L Q N I A H S I A T N H P E C Y L I V L L I D E R P E E   :   2 1 9
R H O _ R I C P R   :   A P M G K G Q R A L I V A P P R T G K T V L L Q N I A H A I T T N N P E V F L I V L L I D E R P E E   :   2 4 6
R H O _ T R E P A   :   C P I G K G Q R A L I V A P P R T G K T I L M Q K I A N A I T Q N H P E V Y L I V L L I D E R P E E   :   3 1 1
R H O _ H E L P J   :   S P V G K G Q R A L I V A P P R T G K T E L M K E L A Q G I T S N H P E V E L I I L L V D E R P E E   :   2 3 4
R H O _ B O R B U   :   S P I G K G Q R A L I V S P P K A G K T T L L Q K I A N A I T T N Y S D V I L M I L L I D E R P E E   :   3 1 0
R H O _ A Q U A E   :   A P I G K G Q R G L I V A P P K A G K T V L L Q K I A Q A I I R N H P E V Y L I I L L I D E R P E E   :   2 3 1
R H O _ T H E M A   :   A P I G K G Q R G M I V A P P K A G K T T I L K E I A N G I A E N H P D T I R I I L L I D E R P E E   :   2 1 9
R H O _ B A C S U   :   A P V G F G Q R G L I V A P P K A G K T M L L K E I A N S I T A N Q P E A E L I V L L I D E R P E E   :   2 1 4
R H O _ S T R L I   :   A P I G K G Q R G L I V A P P K T G K T M I M Q A I A N A I T H N N P E C H L M V V L V D E R P E E   :   4 9 5
                          P   G k G Q R   l i V a P P     G K T           i A     i     N   p       l     l L i D E R P E E            
                                                                                                                                       
                                          *               5 2 0                   *               5 4 0                   *            
R H O _ E C O L I   :   V T E M Q R L V K G - - E V V A S T F D E P A S R H V Q V A E M V I E K A K R L V E H K K D V I I L   :   2 6 3
R H O _ N E I G O   :   V T E M S R S V R G - - E V V S S T F D E P A Q R H V Q V A E M V L E K A K R M V E H K K D V V I L   :   2 6 3
R H O _ R H O S H   :   V T D M Q R S V K G - - E V V S S T F D E P A T R H V A V A E M V I E K A K R L V E H K R D V V I L   :   2 6 7
R H O _ R I C P R   :   V T D M Q R S V R G - - E V V S S T F D E P A S R H V Q L A E M V I E K A K R L V E H K K D V V I L   :   2 9 4
R H O _ T R E P A   :   V T D M E R T V D A - - E V I S S T F D E Q A T R H V Q I A E I V L E R A K R L V E H R K D V V I L   :   3 5 9
R H O _ H E L P J   :   V T D M Q R S V K G - - Q V F S S T F D L P A N N H I R I A E L V L E R A K R R V E M G K D V V V L   :   2 8 2
R H O _ B O R B U   :   V T D M I R S V K G - - E V I A S N F D E Q A S R H V Q V A E M V I E K A K R L V E N K K D V V I L   :   3 5 8
R H O _ A Q U A E   :   V T E M R R I V K D K A E V V A S T F D E P P E R H M Q V A E I V V E K A K R M V E L K K D V V I L   :   2 8 1
R H O _ T H E M A   :   V T D I R E S T N A - - I V I A A P F D M P P D K Q V K V A E L T L E M A K R L V E F N Y D V V I L   :   2 6 7
R H O _ B A C S U   :   V T D I E R S V A G - - D V V S S T F D E V P E N H I K V A E L V L E R A M R L V E H K K Y V I I L   :   2 6 2
R H O _ S T R L I   :   V T D M Q R S V K G - - E V I S S T F D R P A E D H T T V A E L A I E R A K R L V E L G H D V V V L   :   5 4 3
                        V T   m   r   v           V     s t F D           h       A E   v   E   A k R   V E       d V v i L            
                                                                                                                                       
                                      5 6 0                   *               5 8 0                   *               6 0 0            
R H O _ E C O L I   :   L D S I T R L A R A Y N T V V P A S G K V L T G G V D A N A L H R P K R F F G A A R N V E E G G S L   :   3 1 3
R H O _ N E I G O   :   L D S I T R L A R A Y N T V V P A S G K I L T G G V D A N A L H R P K R F F G A A R N V E E G G S L   :   3 1 3
R H O _ R H O S H   :   L D S I T R L G R A F N T V V P S S G K V L T G G V D A N A L Q R P K R F F G A A R N I E E G G S L   :   3 1 7
R H O _ R I C P R   :   V D A I T R L A R A Y N T V V P S S G K V L T G G V D A N A L Q R P K R F F G A A R N I E N G G S L   :   3 4 4
R H O _ T R E P A   :   L D S I T R L A R A Y N Q T M P T S G K V L S G G V D S N A L H K P K R F F G A A R N V E E G G S L   :   4 0 9
R H O _ H E L P J   :   L D S I T R L A R A Y N A V T P S S G K V L S G G V D A N A L H R P K R F F G A A R N I E E G G S L   :   3 3 2
R H O _ B O R B U   :   L D S I T R L A R A Y N Q T M P T S G K I L S G G V D S N A L H K P K R F F G S A R N I E E G G S L   :   4 0 8
R H O _ A Q U A E   :   M D S L T R F T R A S N A V T P P T G R V L T G G I E I T A F Q R P K K F F G A A R N I E E G G S L   :   3 3 1
R H O _ T H E M A   :   L D S L T R L A R V Y N I V V P P S G K L L T G G V D P A A L Y K P K R F F G A A R N T R E G G S L   :   3 1 7
R H O _ B A C S U   :   M D S I T R L A R A Y N L V I P P S G R T L S G G I D P A A F H R P K R F F G A A R N I E E G G S L   :   3 1 2
R H O _ S T R L I   :   L D S I T R L G R A Y N L A A P A S G R I L S G G V D S T A L Y P P K R F F G A A R N I E D G G S L   :   5 9 3
                          D s i T R l   R a y N       P   s G     L   G G v d     A l     P K r F F G a A R N   e e G G S L            
                                                                                                                                       
                                          *               6 2 0                   *               6 4 0                   *            
R H O _ E C O L I   :   T I I A T A L I D T G S K M D E V I Y E E F K G T G N M E L H L S R K I A E K R V F P A I D Y N R S   :   3 6 3
R H O _ N E I G O   :   T I I A T A L V E T G S R M D D V I Y E E F K G T G N M E L H L D R R I A E K R L F P A I N I N K S   :   3 6 3
R H O _ R H O S H   :   T I I A T A L I D T G S R M D E V I F E E F K G T G N S E I V L D R K V A D K R V F P A M D I L K S   :   3 6 7
R H O _ R I C P R   :   T I I G T A L I E T G S R M D E V I F E E F K G T G N S E I V L D R K I A D K R I Y P A I D I T R S   :   3 9 4
R H O _ T R E P A   :   T I I A T A L I E T G S R M D E V I F E E F K G T G N M E I N L D R R L S D R R L F P A V S I K K S   :   4 5 9
R H O _ H E L P J   :   T I I A T A L I E T G S R M D E V I F E E F K G T G N S E I V L A R N I A D R R I Y P A F D I L K S   :   3 8 2
R H O _ B O R B U   :   T I I A T A L V D T G S K M D E V I F E E F K S T G N M E L I L D R S L A D R R L F P A I N I K K S   :   4 5 8
R H O _ A Q U A E   :   T I I A T A L V E T G S K M D D V I Y E E F K G T G N M E I H L D R R L M E R R I F P A I N I E K S   :   3 8 1
R H O _ T H E M A   :   T I I A T A L V E T G S K M D E V I F E E F K G T G N M E L V L S R Q L A N K R I F P A I N L L L S   :   3 6 7
R H O _ B A C S U   :   T I L A T A L V D T G S R M D D V I Y E E F K G T G N M E L H L D R S L A E R R I F P A I D I R R S   :   3 6 2
R H O _ S T R L I   :   T I L A T A L V D T G S R M D E V I F E E F K G T G N A E L K L D R K L A D K R I F P A V D V D A S   :   6 4 3
                        T I i a T A L     T G S   M D   V I   E E F K g T G N   E     L   R     a     R   f P A           S            
                                                                                                                                       
                                      6 6 0                   *               6 8 0                   *               7 0 0            
R H O _ E C O L I   :   G T R K E E L L T T Q E E L Q K M W I L R K I I H P M G E I D A M E F L I N K L A M T K T N D D F F   :   4 1 3
R H O _ N E I G O   :   G T R R E E L L V P N D Q L Q R M W L L R K F L H P M D E I E A T E F L N G K I K A S K N N D D F F   :   4 1 3
R H O _ R H O S H   :   G T R K E D L L V D K S D L Q K T Y V L R R I L N P M G T T D A I E F L I S K L R Q T K S N A E F F   :   4 1 7
R H O _ R I C P R   :   G T R K E D L L V D K I I L N K M W V L R R I I D P M G S S E A I E F L L K K L E N T K T N C A F F   :   4 4 4
R H O _ T R E P A   :   G T R K E E L L L T E E E M Q R I W V L R K V I N P M D D A E I V E L L I D K M R K T K N N E A F L   :   5 0 9
R H O _ H E L P J   :   G T R K D N I L L G K D R L T K V W V L R N V M Q Q M D D I E A L S F V Y S K M Q Q T K D N E E F L   :   4 3 2
R H O _ B O R B U   :   G T R K E E L L L S E E E R S K I L L I R R I L G G V D D Y E G V E V L I E K M K K S K N N E I F L   :   5 0 8
R H O _ A Q U A E   :   G T R K E E L L L E P W E L Q R I W V L R K F L S T M D P V E A M E F L L E K L R R F K T N E E F L   :   4 3 1
R H O _ T H E M A   :   G T R R E E L L L D E E T L K K V W L L R R M L S A M T E E E G L T L I L N K L S E T S S N E E F L   :   4 1 7
R H O _ B A C S U   :   G T R K E E L L V P K E H L D R L W S I R K T M S - - D S P D F A E K F M R K M K K T K T N Q E F F   :   4 1 0
R H O _ S T R L I   :   G T R K E E I L L G S D E L A I T W K L R R V L H A L D Q Q Q A I E L L L D K M K Q T K S N A E F L   :   6 9 3
                        G T R k e   l L           l       w   l R                         e         K         k   N     F              
В этом множественном выравнивании я раскрасил остатки разными цветами по консервативности: 100% — красным и 80% — жёлтым цветом. В соответствии с этим мы видим консервативные остатки белка RHO_ECOLI (самая верхняя строчка) — это те, которые раскрашены красным цветом.

Cмотрите также документ BAliBase.doc

Матрица попарного совпадения последовательностей:

RHO_ECOLIRHO_NEIGORHO_RHOSHRHO_RICPRRHO_TREPARHO_HELPJRHO_BORBURHO_AQUAERHO_THEMARHO_BACSURHO_STRLI
RHO_ECOLI100%
RHO_NEIGO69%100%
RHO_RHOSH66%61%100%
RHO_RICPR61%57%66%100%
RHO_TREPA47%45%47%49%100%
RHO_HELPJ51%54%52%54%45%100%
RHO_BORBU46%44%44%45%54%43%100%
RHO_AQUAE53%54%54%52%44%50%44%100%
RHO_THEMA52%51%51%49%43%49%42%52%100%
RHO_BACSU53%51%51%51%41%48%38%52%52%100%
RHO_STRLI29%28%30%28%30%28%30%28%27%28%100%

Здесь ортологи белка RHO_ECOLI в диапазоне 50%<identity<75%, полученные с помощью программы BlastP. Матрица говорит о том, что в выборку не попали одинаковые последовательности, т.к. нет таких, которые совпадали бы на 90 и более процентов.

3D–структура:

Я определил c помощью программы RasMol, какие аминокислотные остатки в белке RHO_ECOLI находятся на расстоянии не более, чем 5 Å от функционального лиганда. Здесь остовное изображение 3D–структуры моего белка, а изображение лиганда — в шариковой модели. Остатки в зоне контакта представлены в виде шарнирных моделей. В зону контакта входят только Glu47, Met1, Gly–1 и His0. Но! Среди консервативных остатков нет тех, которые встречаются в зоне контакта с лигандом. В принципе этого и следовало ожидать, почему? Потому что Gly-1 и His0 были искусственно присоединены для удержания иона меди, а без них один только Glu не справится с такой задачей, поэтому он и не может носить титул "консервативного остатка". Тогда и медь, по–видимому, не является функциональным лигандом.

Бурлин Антон, 2005