Примеры разных контактов в молекуле HutP_Bacsu

1. Пример гидрофобного контакта

Считается, что между атомами углерода есть гидрофобное взаимодействие, если они находятся на расстоянии, не большем 4А. Я исследую гидрофобные контакты боковой группы Phe141:A (в центре). Атомы, контактирующие с Phe141:A показаны крупными серыми шариками.

2. Примеры водородных связей между боковыми группами

Акцептором и донором являются атомы кислорода.

А здесь акцептором и донором являются атомы азота.

3. Пример дисульфидного мостика

Это дисульфидный мостик инсулина. В моём белке нет дисульфидных мостиков.