| ID белка | AC белка | Число итераций | Для первой итерации | Для последней итерации | ||||
| Число находок выше порога (0,005) | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | Число находок выше порога (0,005) | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | |||
| MINC_ECOLI | P18196 | 6 | 162 | 0.005 | 0.005 | 881 | 0.002 | 0.094 |
| Разрыв практически не меняется. Для самой лучшей находки E-value уменьшается.
Для средней - не понятно, т.к. очень много новых. И вообще, не верится, что все находки - гомологи, особенно последние.
Вывод: расходится. |
||||||||
| SSRP_ECOLI | P0A832 | 3 | 1526 | 0.003 | 0.085 | 1532 | 8e-07 | 0.018 |
| Psi-blast дает всего 6 новых находок. Вывод: Psi-blast не дает ничего нового. |
||||||||
| RP5M_RHIME | P17265 | 618 | 0,005 | 0,005 | >5000 | |||
| Даже при пороге 0,001 в шестой итерации есть новык последовательности. Вывод: расходится, причем очень быстро. |
||||||||
| HUTP_BACSU | P10943.4 | 2 | 12 | 2e-40 | 1.2 | 12 | 1e-58; | 0.17 |
| Psi-Blast в данном случае не эффективней просто Blast. Разрыв увеличивается на 17 порядков.
Значение E-value самой лучшей находки сильно уменьшается на 15 порядков. Для средней подходящей находки E-value увеличивается.
Вывод: Psi-Blast не дает ничего нового. |
||||||||