Укоренение в среднюю точку
Дерево до укоренения:
Дерево после укоренинения:
Укоренение произошло в ветвь {CLOB1, CLOTE} против {STRPN, LACLM, GEOKA, LISMO, STAA1, PEDRA}.
Корень построенного дерева совпадает с корнем правильного.
Метод максимальной экономии не выдаёт длины ветвей.
UPGMA выдаёт уже укоренённое дерево.
Использование внешней группы
Изображение дерева с листом Ecoli:
Укоренение произошло в ветвь {CLOB1, CLOTE} против {STRPN, LACLM, GEOKA, LISMO, STAA1, PEDRA}.
Корень построенного дерева совпадает с корнем правильного.
Бутстрэп
+-------RS7 CLOTE
+--100.0-|
| +-------RS7 CLOB1
+--30.9-|
| | +-------RS7 LISMO
+--52.6-| +--36.4-|
| | +-------RS7 GEOKA
| |
+-------| +-----------------------RS7 PEDPA
| |
| | +-------RS7 LACLM
| +------------------99.0-|
| +-------RS7 STRPN
|
+---------------------------------------RS7 STAA1
Три недостоверные ветви, собственно неправильные. Неправильно расположен лист STAA1.
Если его переместить, получится правильное дерево.
Зато правильно объединены PEDRA, LACLM и STRPN, что не получалось предыдущими методами.