Электронная плотность, кинематическая теория рассеяния, соответствие модели экспериментальным данным
Мой белок из первого семестра - HUTP_BACSU. Это транскрипционный фактор оперона hut у бактерии Bacillus subtilis.
PDB ID структуры белка - 1wmq.
Разрешение структуры - 1,60 A c completeness 99,6%.
Электронная плотность некоторых остатков и кусочка полипептидной цепи
Синим показан уровень подрезки 1,5. Желтым показан уровень подрезки 3.
Первые три остатка расположены вблизи лиганда - иона магния, может поэтому они довольно хорошо вписаны в электронную плотность.
Аргинин расположен на переферии и видно, что он плохо вписан в свою электронную плотность.
