#картинка с приближенным видом CD (ионов кадмия)
select all
#окрашиваем элементы нашего белка в соответствии с принадлежностью к той или иной структуре
color structure
#создание наглядной формы белка
cartoons
#выбираем кадмий с номером 1259
select CD1259
#подписываем кадмий соответственно
label -------CD (1259)
#задаем размеры подписи
set fontsize 30
#выбираем атомы кислорода принадлежащие воде, которая взаимодействует с кадмием 1259
select HOH2041:1.O or HOH2083:1.O or HOH2116:1.O
color blue
label  -----HOH
set fontsize 30
pause
#общий вид белка с выделенными ионами кадмия
select *:1.* or *:2.*
#задаем прозрачность цепям белка
color translucent
select all
#выключаем подписи
label off
pause
#подписываем кадмий, который взаимодействует с 2 молекулами воды, предварительно стоит его найти
select CD3850:1
label ---CD(2)
select HOH2030:1 or HOH2030:1
label ---HOH
select HOH
color blue