Beijerinckia indica

Beijerinckia indica (рис.1) - это бактерия, которая живет в почве, а также в тканях некоторых растений. Аэробна, фиксирует атмосферный азот и является облигатным метанотрофом. У этой бактерии нет фосфофруктокиназы (ключевого элемента гликолиза), вместо нее она использует аналог фосфофрукиназы - Entner. Большинство генов, участвующих в фиксации атмосферного азота, сгруппированы в двух геномных островах. Эта бактерия является достаточно близким родственником облигатным матанотрофам родов Methylocella и Methylocapsa. Она грамотрицательная, бесцветная, в форме прямого или изогнутого стержня. Геномная ДНК этой бактерии использовалась для создания 3-кб, 8-кб и 40-кб библиотек ДНК.

Beijerinckia indica представляет интерес для министерства энергетики США, т.к. она метанотроф.

Рис. 1. Микрофотография B.indica.

Таксономия

› Cellular organisms

› Bacteria

› Proteobacteria

› Alphaproteobacteria

› Rhizobiales

› Beijerinckiaceae

› Beijerinckia

› Beijerinckia indica

Интересные данные о бактерии

У нее есть в общей сложности 3982 открытые рамки считывания (ORF) предсказанные с использованием Glimmer, из которых 3784 прогнозируется белок-кодирующих генов и у 2695 (70%) были отпределенны функции. И есть 134 псевдогена, 52 тРНК гена, и три оперона, каждый из которых содержит 16S, 23S и 5S рРНК. Интересно, что об этой бактерии писали работу исследователи из Canada Discovery Grant Program (P.F.D.). Эта бактерия оптимально существует при pH равном 5 и температуре от 15 до 20 градусов Цельсия.

Анотация статьи в PubMed (для нахождения этой статьи был использован запрос: “Beijerinckia Indica 2000/01:2012/11[dp]”)

PMID (индификатор этой статьи в PubMed): 17085698

Локализацию синтезированных Poly(3-hydroxybutyrate) гранул можно посмотреть на рисунках 2 и 3. Было замечено, что эти гранулы откладывались на уровне или близко к цитоплазматической мембране (для данного анализа использовался метод ПЭМ). Клетки этого вида бактерии питал один вид Poly(3-hydroxybutyrate) гранул в каждой части клетки. Возможные объяснения этой неожиданной находки, и гипотетической модели формирования Poly(3-hydroxybutyrate) гранул еще обсуждаются.


Рис. 2. Общий вид гранул Poly(3-hydroxybutyrate) у B.indica	Рис. 3. Гранулы Poly(3-hydroxybutyrate) в B.indica, видные при помощи конфокальной лазерной сканирующей флуоресцентной микроскопии Нила