Для поиска своего белка в базе Uniprot я ввела в расширенный поиск номер штамма своей бактерии Scandinavium goeteborgense, которую я использовала для мини-обзора. В результате был найден только один белок QnrB96.
Данный белок дает уменьшенную чувствительность к фторхинолоновому антибиотику ципрофлоксацину (пятикратное увеличение минимальной ингибиторной концентрации), когда выражен в E.coli. Принадлежит к семейству белков с пентапептидными повторениями.
В базе данных UniProt были найдены кластеры:
UniRef100_P0DW63
UniRef90_P0DW63
UniRef50_Q2PT27
1. При поиске по названию белка, исключая при этом семейство Enterobacteriaceae, было найдено 76 результатов. Следовательно, этот белок не исключителен лишь для этого семейства.
2. При поиске по имени организма, белка, но исключая название гена, больше белков найдено не было. Получается этот белок кодируется единственным геном qnrB96.
3. При добавлении к 1 пункту условия описания существования белка результаты были найдены только в графе Predicted. Все эти белки описаны на основе предсказания последовательностей, даже не выведения из гомологии, что означает не совсем достоверные данные.