|
На рисунке представлено филогенетическое дерево глобинов. Красными кружками помечены последовательности миоглобинов (соответствует таксономии позвоночных). Желтым помечены ортологичные последовательности (дерево также соответствует таксономии позвоночных). Группа последовательностей, отмеченная синими кружками также является ортологами и, вероятно, к ней относится последовательность, помеченная коричневым кружком (потому как, при занесении данной последовательности в ту же группу, таксономия позвоночных не нарушается). В данной части дерева неизвестно, куда отнести последовательность, помеченную голубым кружком, потому что все человеческие последовательности ближе к двум описанным группам, чем данная. Последовательности, отмеченные серыми кружками, являются паралогами, но какую из них отнести к группе, отмеченной фиолетовыми кружками (которые, видимо, являются ортологами), неизвестно, потому что они одинаково близки к ней. Последовательность, отмеченную оранжевым кружком, также неизвестно, куда отнести. Возможно, она может быть ортологом из группы, отмеченной красными кружками, хотя, ближе относится к группе, отмеченной фиолетовыми кружками. |
|
На рисунке представлена часть филогенетического дерева глутаминосинтетаз.
Одинаковыми цветами отмечены ветви таксономически близких организмов. Зеленым
отмечены последовательности организмов, относящихся к археям,
фиолетовым - бактериям.
Это дерево отображает ход эволюции бактерий и эукариот лишь отчасти: последовательности архей
достаточно близки между собой, хотя между ними "вклинилась" последовательность из бактерий.
Это может объясняться тем, что дерево построено не совсем правильно (так как эволюционные расстояния
между Thermotoga и Halobacterium очень близки и эти ветви можно просто поменять местами). Причина же
того, что последовательности Pasturella и Escherichia так далеки от других последовательностей бактерий
может быть следствием горизонтального переноса, то есть бактерии могли приобрести данный ген от архей.
Таксономия представленных организмов: cellular organisms; Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae cellular organisms; Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae cellular organisms; Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae cellular organisms; Archaea; Euryarchaeota; Halobacteria; Halobacteriales; Halobacteriaceae cellular organisms; Bacteria; Thermotogae; Thermotogae (class); Thermotogales; Thermotogaceae cellular organisms; Archaea; Euryarchaeota; Methanococci; Methanococcales; Methanococcaceae cellular organisms; Archaea; Euryarchaeota; Thermococci; Thermococcales; Thermococcaceae cellular organisms; Archaea; Euryarchaeota; Archaeoglobi; Archaeoglobales; Archaeoglobaceae cellular organisms; Archaea; Crenarchaeota; Thermoprotei; Sulfolobales; Sulfolobaceae cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae |