Создание выборки белков с одинаковыми функциями
Задача – создать выборку белков, выполняющих ту же функцию, что Глутаминил-тРНК синтетаза .

• Часть 1.Краткое описание прототипа по данным банка аминокислотных последовательностей Swiss-Prot, release: 28 февраля 2004 года.
  
• Часть 2. Описание процедуры составления выборки
  При поиске использовалась поисковая система SRS (Sequence Retrieval System), веб-сервер http://srs.ebi.ac.uk
  Поиск происходил следующим образом: в поле DESCRIPTION мы писали полное название белка (Glutaminyl-tRNA synthetase ), в поле SPECIES - название организмов (Escherichia coli, Pasteurella multocida, Yersinia pestis), в поле TAXONOMY- название таксона (Bacteria, Gammaproteobacteria, Firmicutes, Archae, Eukaryota). Для поиска были использованы банки данных UniProt/SwissProt, в основу положен формат SwissProt.
  Результаты поиска:
  
  
  
  
• Часть 3. Описание выборки
  Критерии включаемости последовательности в выборку:
  1)белок обладает теми же описаниями функций, что и исходный;
  2)белок должен отличаться от исходного по строению, должен находиться в разных (желательно родственных организмах).
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  

Главная страница