К оглавлению

Консервативные аминокислотные остатки в выборке 10 потенциальных ортологов TALB_ECOLI

Матрица попарного сходства

4-MAY-2005  19:33

                TAL_HAEDU   TALB_PASMU    TAL_VIBVU    TAL_VIBVY    TAL_VIBPA    TAL_VIBCH    TAL_METAM    TAL_SHEON   TALA_ECOLI   TALA_SALTI 

   TAL_HAEDU          100%                                                                                                                     

  TALB_PASMU           80%         100%                                                                                                        

   TAL_VIBVU           68%          68%         100%                                                                                           

   TAL_VIBVY           68%          68%          99%         100%                                                                              

   TAL_VIBPA           68%          67%          98%          98%         100%                                                                 

   TAL_VIBCH           68%          70%          93%          93%          93%         100%                                                    

   TAL_METAM           63%          65%          67%          67%          66%          69%         100%                                       

   TAL_SHEON           66%          64%          69%          69%          69%          70%          64%         100%                          

  TALA_ECOLI           66%          62%          63%          63%          63%          64%          61%          65%         100%             

  TALA_SALTI           64%          62%          62%          62%          62%          63%          61%          64%          89%         100%


Mножественное выравнивание

Изображение 3D-структуры белка с отмеченными консервативными остатками

Рассуждения

К лиганду подходят несколько петель, которые являются почти совершенно консервативными.

© Шпильман Алексей, 2005