Описание префлагеллин пептидазы из генома археи Methanococcus maripaludis C6.

Основная информация о белке

Я изучила белок префлагеллин-пептидаза из генома археи Methanococcus maripaludis C6. Данные о белке, полученные на сайтах NCBI и UniProt, приведены в Таблице 1

Таблица 1. Описание префлагеллин-пептидазы из генома археи Methanococcus maripaludis C6
Идентификатор белка ABX01159.1
Идентификатор генома CP000867.1
Название белка Preflagellin peptidase
Координаты гена в геноме 302898..303590
Длина гена (п.н.) 693
Цепь обратная
Длина белка (а.о.) 230

Последовательность белка получена на сайте NCBI ➪ скачать последовательность белка

☝ Название белка говорит о том, что перед нами фермент. Он участвует в ряде химических реакций, в ходе которых расщепляется префлагеллин. Результатом таких реакций можно считать получение флагеллина - белка, который способен самоорганизовываться в полые цилиндрические структуры, образующие филаменты бактериальных жгутиков.

Геномное окружение гена белка

С помощью базы данных NCBI был изучен ген, кодирующий префлагеллин-синтетазу. Совершён поиск по типу Nucleotide и найден необходимый ген в соответствии с его координатами в Graphics. Геномное окружение гена данного белка приведено на рисунке 1.

image
Рисунок 1. Геномное окружение гена белка префлагеллин-пептидаза (ABX01159.1). Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI.

✔ Изучен белок префлагеллин-пептидаза археи Methanococcus maripaludis C6 и составлено его описание. Найден кодирующий данный белок ген, его нуклеотидная последовательность и геномное окружение.