Метаболические пути

• Что было сделано:
• был проведен анализ ID HEXA с помощью KEGG

Анализ с помощью KEGG

1. Ниже можно посмотреть картинку референсного пентознофосфатного пути:

2(+3). Далее можно увидеть референсный путь выбранной мной реакции под кодом R01519: превращение D-Глюконо-1,5-лактона в D-глюконовую кислоту путем гидролиза (D-Glucono-1,5-lactone + H2O <=> D-Gluconic acid).

4. Данная реакция проводится с помощью D-Глюконо-1,5-лактон лактоногидролазы.

5. У данного фермента [4] следующие функции:

• 3. гидролазы - класс ферментов, катализирующий гидролиз ковалентной связи
• 3.1. ферменты, действующие на сложноэфирные связи
• 3.1.1. гидролазы карбоновых эфиров
• 3.1.1.7. D-глюконо-1,5-лактон лактоногидролаза

6. Ниже представлен референсный пентознофосфатный путь для Arabidopsis thaliana и Danio rerio соответственно.

7. Для Arabidopsis thaliana число метаболических путей - 137 (KEGG PATHWAY так сказал), а число генов - 27636 белковых и 1066 РНК генов (KEGG GENOME так сказал).