Информация о бактерии Dyadobacter fermentans DSM 18053

Род – Dyadobacter, вид - fermentans, штамм - DSM 18053 Домен - Bacteria Грамотрицательная аэробная палочковидная неподвижная бактерия Является мезофилом, хемоорганогетеротрофом Обитает внутри клеток кукурузы (является эндофитом). Взаимоотношения с растением - нейтральные Идентификатор RefSeq - NC_013037 Длина последовательности полного генома - 6967790 п.н. ДНК - кольцевая Число генов, кодирующих белки - 5855

Photo credit: Dr. Manfred Rohde at Helmholtz Centre for Infection Research, Braunschweig, Scale = 2 µm.

  Окружение гена белка YP_003087070.1 в геноме бактерии

• Окружение гена белка показано на Рис.1
• Соседние гены кодируют: 5' - YP_003087069.1 (возможный белок); 3' - YP_003087071.1 (возможный белок)
• Соседний ген с 3' конца: направление: -1, расстояние до YP_003087070.1: 279 п.н., рамка считывания относительно YP_003087070.1: -0
• Соседний ген с 5' конца: направление: -1, расстояние до YP_003087070.1: 68 п.н., рамка считывания относительно YP_003087070.1: -2;
• В один оперон эти 3 гена входить не могут, т.к. гены имеют разное направление
• Ближайшие гены с 5' и 3' стороны на комплементарной цепи - на расстоянии 0 генов
• Ген белка YP_003087070.1 и его более дальние, чем перечисленные, соседи, возможно, входят в один оперон, отвечающий за гликолиз

Рис. 1. Окружение гена белка YP_003087070.1 в геноме бактерии

Источник информации: GenBank