Fructose-bisphosphate aldolase, class II
Задание 1
Таблица. Идентификаторы белка в различных базах данных
| БД | Идентификатор |
| UniprotKB | ID: C6W2Q1_DYAFD, AC: C6W2Q1 |
| Uniref50 | UniRef50_Q9URB4 |
| RefSeq Protein | WP_015812155.1 |
| PDB | – |
Задание 2
Дата создания 1-й версии - 2009-09-22, 35-й (последней) - 2015-02-04.
Изменения:
- + ID C6W2Q1_DYAFD #Изменен идентификатор записи
- + DE SubName: Full=Fructose-bisphosphate aldolase, class II {ECO:0000313|EMBL:ACT93905.1};
+ DE EC=4.1.2.13 {ECO:0000313|EMBL:ACT93905.1}; #Добавлена куча новых идентификаторов
- + OC Bacteria; Bacteroidetes; Cytophagia; Cytophagales; Cytophagaceae; #Обновлена классификация
- + RN [1] {ECO:0000313|EMBL:ACT93905.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000002011}
+ RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
+ RC STRAIN=ATCC 700827 / DSM 18053 / NS114
+ RC {ECO:0000313|Proteomes:UP000002011};
+ RX DOI=10.4056/sigs.19262;
+ RA Lang E., Lapidus A., Chertkov O., Brettin T., Detter J.C., Han C.,
+ RA Copeland A., Glavina del Rio T., Nolan M., Chen F., Lucas S., Tice H.,
+ RA Cheng J.-F., Land M., Hauser L., Chang Y.-J., Jeffries C.C.,
+ RA Kopitz M., Bruce D., Goodwin L., Pitluck S., Ovchinnikova G., Pati A.,
+ RA Ivanova N., Mavromatis K., Chen A., Palaniappan K., Chain P.,
+ RA Bristow J., Dalin E., Eisen J.A., Markowitz V., Hugenholtz P.,
+ RA Goeker M., Rohde M., Kyrpides N.C., Klenk H.-P.;
+ RT "Complete genome sequence of Dyadobacter fermentans type strain
+ RT (NS114).";
+ RL Stand. Genomic Sci. 1:133-140(2009). #Добавлен новый референс
- + DR RefSeq; WP_015812155.1; NC_013037.1.
+ DR RefSeq; YP_003087070.1; NC_013037.1.
+ DR ProteinModelPortal; C6W2Q1; -.
+ DR STRING; 471854.Dfer_2688; -.
+ DR EnsemblBacteria; ACT93905; ACT93905; Dfer_2688.
+ DR GeneID; 8226260; -. .......... #Добавлены ссылки на внешние источники информации
- + KW Complete proteome {ECO:0000313|Proteomes:UP000002011};
+ KW Lyase {ECO:0000256|SAAS:SAAS00132197, ECO:0000313|EMBL:ACT93905.1};
+ KW Metal-binding {ECO:0000256|SAAS:SAAS00132199};
+ KW Reference proteome {ECO:0000313|Proteomes:UP000002011};
+ KW Zinc {ECO:0000256|SAAS:SAAS00132210}.
+ FT REGION 265 267 Dihydroxyacetone phosphate binding.
+ FT {ECO:0000256|PIRSR:PIRSR001359-2}.
+ FT REGION 286 289 Dihydroxyacetone phosphate binding.
+ FT {ECO:0000256|PIRSR:PIRSR001359-2}.
+ FT ACT_SITE 109 109 Proton donor.
+ FT {ECO:0000256|PIRSR:PIRSR001359-1}.
+ FT BINDING 227 227 Dihydroxyacetone phosphate; via amide
+ FT nitrogen. {ECO:0000256|PIRSR:PIRSR001359-
+ FT 2}. #Добавлена информация о лиганде - цинке, о расположении активного центра и участках цепи, связывающих субстрат
Задание 3
Гомологи отличаются в основном длиной. Один из гомологов был найден в E. coli и потому отлично описан (даже его наличие экспериментально подтверждено).
Данные о гомологах представлены в Таблице .
Задание 4. Селеноцистеин в последовательности белка.
FT NON_STD 196 196 Selenocysteine.
Так представлено наличие селеноцистеина в последовательности белка.
Назад
© Sergey Starikov, 2014