Дерево
BLOSUM
ClustalX
Блоки, кластеры
Гомология
Jalview project - blocks, clusters, homology
Последовательности ENTFO,LACLK,LISML похожи друг на друга, оличаются от остальных аминокислотной последовательностью. На построенном в 1 задании дереве близки.
На самом длинном участке, не входящем в состав блоков и кластеров 1 геп (4.55%)
Вписал вручную последовательность EUBR3.
Вписал вручную последовательность 1B57 (PDB) своего белка. В 1 позиции (0.95%) - абсолютная консервативность, в 6 (5.71%)- абсолютная функциональная консервативность.
Выравнивал последовательности с PDB - 3VMF;1ML4;3ICP;2PMD;3GBR. Ничего хорошего не вышло. Блоков и, соответственно, кластеров нет.
Назад