Protein domains

Задание 1

Найден один домен: F_bP_aldolase (PF01116)

Seed выравнивание семейства

Задание 2

Консенсусная последовательность блока в seed выравнивании

LOGO блока:

Задание 4

Сильный паттерн: G-[IV]-x-K-[IV]-N-[IV]-x-T; найдено 92 последовательности (Swissprot) (и все - различные Fructose-bisphosphate aldolase, как и мой белок)

Слабый паттерн: G-[IVMLF]-x-K-[IVMF]-N-[IVMLF]-x-[ST]; найдена 151 последовательность (Swissprot)

По слабому паттерну находок больше, а качество их ниже (по сильному паттерну гомология более вероятна)

Jalview project


Назад
© Sergey Starikov, 2014