Филогенетические деревья

Задание 1

Отобранные бактерии

Название Мнемоника
Burkholderia cenocepacia BURCA
Pseudomonas aeruginosa PSEAE
Escherichia coli ECOLI
Erwinia tasmaniensis ERWT9
Yersinia pestis YERPE
Proteus mirabilis PROMH
Haemophilus influenzae HAEIN
Vibrio cholerae VIBCH

Скобочная формула дерева

(BURCA, (PSEAE, (VIBCH, (HAEIN, (PROMH, (YERPE, (ERWT9, ECOLI)))))));

Изображение дерева

Ветви дерева

    Дерево содержит следующие нетривиальные ветви:
  1. (BURCA, PSEAE) - (VIBCH, HAEIN, PROMH, YERPE, ERWT9, ECOLI)
  2. (BURCA, PSEAE, VIBCH) - (HAEIN, PROMH, YERPE, ERWT9, ECOLI)
  3. (BURCA, PSEAE, VIBCH, HAEIN) - (PROMH, YERPE, ERWT9, ECOLI)
  4. (BURCA, PSEAE, VIBCH, HAEIN, PROMH) - (YERPE, ERWT9, ECOLI)
  5. (BURCA, PSEAE, VIBCH, HAEIN, PROMH, YERPE) - (ERWT9, ECOLI)

Таксономия

BURCA:
Proteobacteria, Betaproteobacteria, Burkholderiales, Burkholderiaceae, Burkholderia

PSEAE:
Proteobacteria, Gammaproteobacteria, Pseudomonadales, Pseudomonadaceae, Pseudomonas

ECOLI:
Proteobacteria, Gammaproteobacteria, Enterobacteriales, Enterobacteriaceae, Escherichia

ERWT9:
Proteobacteria, Gammaproteobacteria, Enterobacteriales, Enterobacteriaceae, Erwinia

YERPE:
Proteobacteria, Gammaproteobacteria, Enterobacteriales, Enterobacteriaceae, Yersinia

PROMH:
Proteobacteria, Gammaproteobacteria, Enterobacteriales, Enterobacteriaceae, Proteus

HAEIN:
Proteobacteria, Gammaproteobacteria, Pasteurellales, Pasteurellaceae, Haemophilus

    Нетривиальные ветви отделяют следующие таксоны:
  1. Ветвь 3 отделяет отряд Enterobacteriales
  2. Ну и все, кажется.

Моя главная страница
© Sergey Starikov, 2015