Анализ ЯМР файла

1. Белок - человеческий тиоредоксин, PDB ID (ЯМР, 10 моделей)- 1F40, PDB ID (РСА) - 1FKB
2. Разрешение структуры 1.7 Å

Рис.1. Изображение структуры РСА (красная) и 10 всех 10 моделей ЯМР (зеленая) (transparency=0.7).

Были выбраны следующие водородные связи:
1. Остовная в β-листе: PHE99`O - LEU74`N
2. В петле на поверхности белка: HIS87`O - ILE90`N
3. С участием боковых цепей: SER39`Og - TYR26`N

Рис. 2. Остовная водородная связь в β-листе

Рис. 3. Водородная связь в петле на поверхности белка

Рис. 4. Водородная связь с участием боковых цепей

Итоговая таблица

Результаты эксперимента ЯМР полностью подтверждают результаты эксперимента РСА - все выбранные водородные связи присутствовали во всех моделях и имели одинаковую длину, практически совпадавшую с длиной этих связей для модели из эксперимента РСА.

PS: В процессе выполнения задания оказалось, что ЯМР модели отличались только для лиганда, а для белка координаты совпадали. Надеюсь на понимание.