Учебный сайт Юдиной А.С.

Главная

Обо мне

Семестры

Описание генома вируса Bear Canyon virus

Bear Canyon virus - представитель семейства Arenaviridae. Геном представлен двуцепочечной РНК, состоит из двух сегметнов: S и L, в каждом из которых закодировано по два гена. Содержит две открытые рамки считывания.

  • Сегмент S - белки капсида и гликопротеиды.
  • Сегмент L - РНК-полимераза и Z-белок. [1]

Вирус был обнаружен на юге Калифорнии в районе Bear Canyon при изучении популяции грызунов рода Peromyscus, в результате чего и получил свое название. Благодаря открытию и изучению нового вируса стало известно больше о путях передачи, основных хозяевах и структуре геномов семейства Arenaviridae.
Изучению Ареновирусов в наши дни уделяется много внимания, т.к. шесть ныне известных представителей этого семейства являются возбудителями тяжелых заболевания человека. Например: острое поражение ЦНС (LCMV), лихорадка Ласса (LASV) и геморрагическая лихорадка. [2]

Таблица 1

Параметр Значение
Английское название вируса Bear Canyon virus
Русское название вируса Вирус Бэарского Каньона
Количество фрагментов в полном геноме 2
Общая длина генома (п.н.) 10 441
Количество кодируемых в геноме полипептидов 4
Количество "зрелых" вирусных белков 0

Самая короткая аминокислотная последовательность: 

>YP_001649224.1 Z protein
MGLRYSREVKQRYGEKELEGRIPITLDMPQTLYGRYNCKSCWFANKGLIKCSNHYLCLKC
LTAMLSRSDYCGICGGILPKKLVFETTPSAPPYTP

Источники:

[1]Аренавирусы - Wikipedia.org, 2016
[2]Fulhorst CF., Bear Canyon Virus: An Arenavirus Naturally
Associated with the California Mouse (Peromyscus californicus), Emerging Infectious Diseases, 2002Jul

© Юдина Анастасия, 2016