Учебный сайт Юдиной А.С.

Главная

Обо мне

Семестры

Зарисовка молекул в программе MarvinSketch.

Зарисовка нуклеотидов

На рис.1 представлены 2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат, уридин и псевдоуридин. Пронумерованы атомы азотистых оснований и сахара. Все связи и атомы выделены черным, за исключением атомов, образующих N-гликозидную связь - ковалентную связь между сахаром и 1-ым, в случае пиримидинов, атомом азота или 9-ым, в случае пуринов, атомом азота.

Зарисовка фрагментов нуклеиновых кислот

На рис.2 представлен фрагмет двуцепочечной молекулы ДНК, последовательность нуклеотидов в которой -TCAG-. Водородные связи между азотистыми основаниями обозначены пунктирными линиями, сахаро-фосфатный остов выделен красным цветом.

Каноническая пара с участием гуанина

Азотистое основание гуанин образует каноническую пару с цитозином, она представлена на рисунке 3. в этой паре устанавливается три водородные связи.

Неканонические пары

В образовании неканонических пар азотистых оснований большую роль играют таутомеры. Таутомерия для азотистых оснований - это перемещение атома водорода от одного атома к другому в пределах молекулы одного основания.

1. Без образования таутомеров гуанин может образовывать пары с:
   • тимином, при этом возникают две водородные связи;
   • вторым гуанином, также с возникновением двух водородных связей.
   
   Рис.4

2. При образовании таутомеров возникают следующие пары оснований:
   • гуанин с таутомером тимина, у которого водород от 3-его атома азота в цикле переходит на кислород, отходящий от 4-ого атома углерода в цикле, в паре образуется три водородные связи;
   • тимин с таутомером гуанина, у которого водород с 1-ого атома азота в цикле переходит на кислород, отходящий от 6-ого атома углерода в цикле, такая пара удерживается также тремя водородными связями.
   
   Рис.5