Состав записи 1CTF банка PDB

Название молекулы: L7/L12 50 S ribosomal protein

 HEADER    RIBOSOMAL PROTEIN                       02-SEP-86   1CTF      1CTF   3

Строка HEADER содержит заголовок структуры, дату открытия и идентификатор записи. Строка TITLE отсутствует.
В строке COMPND приведена информация о цепях макромолекулы, которая, так же, как и исследуемый ранее белок RL7_ecoli состоит из одной цепи.
Проанализировав поле SEQRES, становится понятно, что данный рибосомный белок и белок RL7 имеют разное количество аминокислотных остатков, но, начиная с 48 остатка, последовательность белка RL7 представляет собой полную последовательность RIBOSOMAL PROTEIN, что, равно как и название, указывает на схожесть их свойств и, одинаковое местонахождение – 50S субъединица рибосомы бактерии.
Программа RasMol отображает только 68 остатков, опуская первые шесть остатков.
Строки HET и FORMUL (строка HETNAM отсутствует)

HET    SO4      1       5     SULFATE 
FORMUL   2  SO4    O4 S1              
FORMUL   3  HOH   *62(H2 O1)

указывают на наличие в цепи 5 атомов сульфата и 62 молекул воды, окружающих белок.

Внешний вид цепи в остовной модели

Поскольку белок состоит из одной цепи, то её характеристика полностью совпадает с характеристикой всего белка: она содержит 74 аминокислотных остатка, имеет как альфа-спирали (3 штуки), так и 3 бета-тяжа. На рисунке представлена вся модель цепи из 68 аминокислот, с раскраской по различным структурам.

Изображение белка в остовной модели вместе с лигандами в шарнирной модели

На главную