Торсионные углы

Построенная средствами Excel карта Рамачандрана для всех остатков цепи. Различные остатки на карте выделены различными цветами.

К сожалению, выбранная цепь имеет лишь один остаток пролина (бирюзовый квадрат в четвёртом координатном углу), поэтому нельзя проследить особенности карты Рамачандрана для Pro. Данная иминокислота, в силу своей структуры, отличается конформационными ограничениями и не может иметь большой разброс углов. Также на карте Рамачандрана никогда нельзя увидеть пролин в первом или во втором квадранте. Глицин же, наоборот, за счёт того, что имеет маленький радикал, обладает наименьшими конформационными ограничениями, точки, соответствующие этой аминокислоте на карте Рамачандрана разбросаны по всему полю. Данные особенности позволяют использовать глицин в местах, где необходима нестандартная конформация, например, при поворотах пептидной цепи.

Назад

На главную