Семейства доменов

Доменная организация белка RL7_Ecoli
(по базе данных Pfam )

Cхематическое изображение доменной структуры RL7_Ecoli:
Пространственная структура домена RL7_Ecoli (идентификатор PDB 1ctf):

На картинке изображен весь домен, бета-тяжи выделены стрелками.

Домены в последовательности RL7_Ecoli:

Идентификатор Pfam	Название записи	Полное название домена	Положение в последовательности RL7_Ecoli
PF00542	Ribosomal_L12	C-концевой домен рибосомального белка L7/L12	54-121

Описание C-концевого домена белка RL7_Ecoli

Краткая характеристика домена PF00542: Данные представляют собой сводку о С-концевом домене белков большой субъединицы, известных, как семейство L7/L12. Белки этого семейства организуются в каждой 50S субъединице в виде двух димеров. Возможно, димер L7/L12 взаимодействует с фактором элонгации Tu (EF-Tu).

Организмы, в которых найдены белки с доменами PF00542:

Таксон		Количество белков с доменом PF00542
Эукариоты	Растения	-
	Грибы	20
	Животные	23
Прокариоты	Бактерии	597
Прокариоты	Археи	-

Всего известно 711 белков с доменами PF00542.
Во всех известных случаях домен PF00542 единственный домен в белке.
Случаи дупликации домена PF00542 или его замены с другим доменом не известны.

Мотивы в аминокислотной последовательности RL7_Ecoli по данным БД InterPro

Изображение всех подписей в белке RL7_Ecoli:

Мотивы в белке RL7_Ecoli по данным БД InterPro:

Название подписи	Положение в последовательности RL7_Ecoli	Полное название базы данных	* Название организации, поддерживающей данную БД.	* Город и страна
TIGR00855	1-121	Comprehensive Microbial Resource	J. Craig Venter Institute	Роквиль, США
PD001326	62-100	ProDom	Universite Claude Bernard	Виллербан, Франция
PF00542	54-121	Pham	Wellcome Trust Sanger Institute	Кембридж, Англия
G3DSA:3.30.1390.10	48-121	CATH Protein Structure Classification	-	-
SSF54736	54-121	Superfamily	Stanford University University of Texas at Austin University of Bristol	США США Англия
PTHR11809	6-121	PANTER	-	-

На главную

©Степанова Вита