Классификация функций. Коды ферментов

  1. Условные обозначения

    2. EC.5.3.1.9
  2. EC.5 - Isomerases - Изомеразы;
  3. EC.5.3 - Intramolecular Oxidoreductases - Внутримолекулярные оксидоредуктазы;
  4. EC.5.3.1 - Interconverting Aldoses and Ketoses - Ферменты, взаимозаменяющие альдозы и кетозы;
  5. EC.5.3.1.9 - Glucose-6-phosphate isomerase - Глюкозо-6-фосфат изомераза;

  6. Сравнение последовательностей с одинаковым кодом

    7. С помощью SRS в базе UniProt найдём все ферменты, отвечающие запросу:
    (([swissprot-AllText:5.3.1.9*] & [swissprot-AllText:EC*]) & (([swissprot-ID:*_ECOLI*] | [swissprot-ID:*_HUMAN*]) | [swissprot-ID:*_METJA*]))
    Всего по данному запросу нашлось 3 фермента, по одному в каждом организме.

        Фермент 1 (Ecoli, AC:P0A6T1) Фермент 2 (Human, AC:P06744) Фермент 3 (Methanococcus jannaschii, AC:Q59000)
      Идентификатор, название домена Pfam Положение в последовательности Положение в последовательности Положение в последовательности
    Домен 1 PF00342, Phosphoglucose isomerase 52-541 54-546 62-287 и 344-389

    Сравним полученные нами домены и белки, выравнивания muscle можно посмотреть здесь:


    Вывод:ферменты и домены, отвечающие за их активность гомологичны, при чём белки человека и кишечной палочки имеют большее сходство.

Назад

На главную

©Степанова Вита